Hello everyone!<br /><div>I have tried to troubleshoot this on my own for the past two weeks with no success. Could I get some advice? Here is my process:</div><div><ol><li>I prepared a 256 Ga atom slab with XYZ periodicity.<br />The stress tensor and pressure fluctuations matched my calculated fluctuation values. I got good convergence for temperature.<ol><li>I creating a bulk structure of my desired final dimensions. Vacuum padding was 1/2 of the interatomic distance of Ga-Ga bond (ca 1.35 A). GEO_OPT.</li><li>NVT MD</li><li>NPT MD</li><li>Added vacuum layer in the z-direction to form a surface.</li><li>NPT MD. (last restart, stress trajectory and output: <u>Ga1_NPT_vac_15-1.restart</u> <u>Ga1_NPT_vac_15-1.stress</u> <u>18202783.out</u>)</li></ol></li><li>I prepared an explicit solvent structure using Maestro Schrodinger and added it on top. (<u>Ga_solvent.xyz</u>). Total 1690 atoms. <br />I have been trying since to run GEO_OPT with XY periodicity to no avail (<u>geoopt (2).in</u>). All of my attempts result in the Index to Radix Array Not Found error.<br />See <u>18821106.out</u> for example.</li></ol><div>So far, I have tried to:</div><div><ul><li>Reduce CUTOFF and REL_CUTOFF from 600, 60 to 400, 40.</li><li>Rounding off my unit cell dimensions.</li><li>Changed FFT library.</li><li>Added vacuum in Z.</li><li>Switched POISSON_SOLVER from WAVELET to MT.</li></ul><div>And I am still getting the same error. I have hit a wall with my understanding of the software and I am hoping someone will help me understand what is going on. Is my only option to do XYZ periodicity? </div><div><br /></div><div>Thank you very much,</div><div><br /></div><div>Michela Cavalieri</div></div></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/bc841bf2-f952-4c9d-a999-bbfa0c2c0f3fn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/bc841bf2-f952-4c9d-a999-bbfa0c2c0f3fn%40googlegroups.com</a>.<br />