<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Aptos;
        panose-1:2 11 0 4 2 2 2 2 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Aptos",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Aptos",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;
        mso-ligatures:none;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body lang="en-CH" link="blue" vlink="purple" style="word-wrap:break-word">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="DE-CH" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US">Hi<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="DE-CH" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US">That message is just a hint and not an error message. It should not cause a crash of the job. There is most likely another problem causing the crash.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US">Best<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US">Matthias<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div id="mail-editor-reference-message-container">
<div>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal" style="mso-margin-top-alt:0cm;margin-right:0cm;margin-bottom:12.0pt;margin-left:36.0pt">
<b><span style="color:black">From: </span></b><span style="color:black">cp2k@googlegroups.com <cp2k@googlegroups.com> on behalf of Michela Benazzi <bnzmichela@gmail.com><br>
<b>Date: </b>Friday, 27 June 2025 at 18:47<br>
<b>To: </b>cp2k <cp2k@googlegroups.com><br>
<b>Subject: </b>[CP2K:21597] Many jobs with same .in and CPU requirements, only one fails due to error<o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt">Hello CP2K community!<br>
<br>
I am getting the error described <a href="https://www.cp2k.org/faq:hint_insufficiently_exploiting_cpu_extensions">
here</a> for only one of many simulations using the same CPU requirements:<br>
<br>
*** HINT in environment.F:920 :: The compiler target flags (generic) used *** *** to build this binary cannot exploit all extensions of this CPU model *** *** (x86_avx512). Consider compiler target flags as part of FCFLAGS and *** *** CFLAGS (ARCH file). ***<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt">I am not sure why one of my jobs is not running due to this error, while my other jobs are smooth sailing. The input files are also identical except for file names. The number and kinds of atoms are the same,
 but the xyz configurations are different.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt">Any thoughts?<br>
<br>
Thank you!<br>
<br>
Here is the<u> sbatch file text:</u><o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt"><br>
#!/bin/bash<br>
#SBATCH -p short<br>
#SBATCH --mem=20G ##memory per task<br>
#SBATCH --job-name=en1<br>
#SBATCH --ntasks=8<br>
#SBATCH --cpus-per-task=7<br>
#SBATCH -N 1 ## containers can only run on one node, and c*n = 56 or 128 (intel nodes top out at 56 cores, zen2 at 128)<br>
#SBATCH --constraint=ib<br>
#SBATCH --time=24:00:00<br>
#SBATCH -o %j.out<br>
#SBATCH -e %j.err<br>
 <br>
#set up the number of OpenMP threads:<br>
 export OMP_NUM_THREADS=8 ## should be the same as cpus-per-task<br>
 <br>
#The setup_new file contains all the instructions for setting up the correct environment before the user can compile and/or run CP2K:<br>
<br>
export PATH=$PATH:/shared/centos7/cp2k/cp2k-6.1.0/data<br>
dir=/home/benazzi.m/BHT/<br>
inputFile=$dir/edge1.in<br>
<br>
apptainer run -B /projects:/projects /shared/container_repository/cp2k/cp2k_2024.1_openmpi_generic_psmp.sif mpirun -n 16 --oversubscribe cp2k.psmp -i $inputFile
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:36.0pt">-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to
<a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br>
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9ccc001a-b163-43eb-b9b1-30f32e6c7226n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">
https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9ccc001a-b163-43eb-b9b1-30f32e6c7226n%40googlegroups.com</a>.<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ZR2P278MB1146E41C50C7621B537EBDD4F446A%40ZR2P278MB1146.CHEP278.PROD.OUTLOOK.COM?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ZR2P278MB1146E41C50C7621B537EBDD4F446A%40ZR2P278MB1146.CHEP278.PROD.OUTLOOK.COM</a>.<br />