Hi Mawuli<div><br /></div><div>It is exactly thanks to the accumulation of additional sampling that the shape  of the FES changes. </div><div>This is the scope of metadynamics. I do not see anything strange in the plots, actually it seems to  work pretty well.</div><div><br /></div><div>Regards</div><div>Marcella<br /><br /></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, May 21, 2025 at 5:17:44 PM UTC+2 Mawuli wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hi Marcella,<br><div><br></div><div>
 My goal is to analyze the convergence of my simulations. 

<br>I’m trying to figure out why the free energy surface in dataset 11 shows a higher energy well compared to datasets 9 and 10, despite being a continuation, and if such cases do occur.</div><div><br></div><div>
Yes, I restarted the metadynamics simulations to collect additional data. 

<br></div><div><br>Thank you.</div><div>Mawuli</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, May 21, 2025 at 4:26:06 AM UTC-4 Marcella Iannuzzi wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi ...<div>I am not sure of understanding your question correctly. </div><div>If you are restarting metadynamics and collecting more data, the earlier sampling was simply not converged yet. </div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, May 21, 2025 at 9:05:51 AM UTC+2 Mawuli wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Hi,</div><div><br>Could someone please help me figure out why my well-tempered metadynamics sampled a higher energy well after sampling a lower one? <br>For instance, within the range of 0.5 to 1.0, Data 11 (purple color) shows a higher energy than Data 8 to Data 10. After another sampling, a lower energy is obtained for Data 12. <br></div><div><br>I generated all these data points (fes.dat) using the CP2K graph tool. <br><br></div><div>Thank you.</div><div><br></div><br></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/8e3b3558-0f75-4ac1-b532-6878a664014cn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/8e3b3558-0f75-4ac1-b532-6878a664014cn%40googlegroups.com</a>.<br />