<p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">Hi everyone!</p><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">I'm trying to perform an Adaptive Buffered Force (AdBF) QM/MM simulation on a protein's active site using CP2K. I want to define certain protein residues and my ligand as part of the static core QM region, and I would like only water molecules to be adaptively incorporated into the QM region — based on their proximity to this core.</p><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">I've set up my input file accordingly (see attachment), but I'm not sure if it's correct. The simulation should not adaptively include protein residues or ions, only water.</p><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">However, I keep getting the following error:</p><blockquote style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);"><p>"add_new_label tried to add more atoms than allowed by &FORCE_MIXING&MAX_N_QM!"</p></blockquote><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">I'm wondering if anyone has tips on how to:</p><ul style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);"><li><p>Restrict adaptive QM region to only water molecules (Avoid incorporating ions or other additional protein atoms)</p></li><li><p>Properly balance the R_QM, R_BUF, and MAX_N_QM parameters</p></li></ul><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">Thanks in advance for any advice or examples — I’d really appreciate your help!</p><p style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0);">Best regards,<br />Daniel</p>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/a394a851-c5e9-4792-9e17-9fa693a760bfn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/a394a851-c5e9-4792-9e17-9fa693a760bfn%40googlegroups.com</a>.<br />