<div>Hello Dr. Stein,</div><div><br /></div><div>Thank you for the reminder. Just to update everyone on how I fixed it, my process was:</div><div><br /></div><div>1. Trying IMPLICIT POISSON_SOLVER. That gave me this error: "No stress tensor is implemented for the implicit Poisson solver".<br />     > My first MD step converged, then the simulation crashed and I got this error. I unfortunately do need a stress tensor (I was using ANALYTICAL) because I will eventually increase the pressure of my unit cell after converging at 1 bar. So, I tried:</div><div>2. ANALYTIC POISSON_SOLVER (kept ANALYTICAL STRESS_TENSOR). The error was: "
Stress Tensor not tested for 2D systems".<br />     > Even after checking CP2K source code, I was a bit confused. I am not sure if it is a CP2K limitation; I checked the papers linked under POISSON_SOLVER and I could not understand how to check for compatibility with different stress tensor. If anyone has a few minutes, I would love a tip!<br />3. ANALYTIC POISSON_SOLVER, NUMERICAL STRESS_TENSOR. Running smoothly with no errors.</div><div><br /></div><div>Thank you kindly for your time!<br /><br />Michela<br /></div>

<br /><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, January 15, 2025 at 1:03:59 PM UTC-5 Frederick Stein wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div>Hi Michela,</div><div>Correct. CP2K defines default values for most input keywords. The default value for CUTOFF is 280 Ry by the way. In the manual, the defaults are provided in the format "<keyword>: <type of keyword> = <default value>".</div><div>Thus, you should always set the PERIODIC keyword.<br></div><div>Best,</div><div>Frederick<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">Michela Benazzi schrieb am Mittwoch, 15. Januar 2025 um 18:50:36 UTC+1:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Frederick, thank you for your response! However, I do not have an active POISSON keyword/section. Are you saying that the POISSON solver is being used anyways?<br><br>Michela<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, January 14, 2025 at 9:30:52 AM UTC-5 Frederick Stein wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Dear Michela,</div><div>By default, the Poisson solver assumes 3D-periodic systems (compare the manual <a href="https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL/DFT/POISSON.html" rel="nofollow" target="_blank" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=en&q=https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL/DFT/POISSON.html&source=gmail&ust=1737567324173000&usg=AOvVaw0T7oh3NcyXgXF4PAtNBF0L">https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL/DFT/POISSON.html</a>).</div><div>Best,</div><div>Frederick<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">Michela Benazzi schrieb am Dienstag, 14. Januar 2025 um 15:29:12 UTC+1:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello everyone,<br><br>I am getting this error:<br>
<span>*** WARNING in pw_env_methods.F:742 :: The selected periodicities in the ***
 *** sections &CELL and &POISSON do not match<br><br></span><div><span>However, if you view my input file <b>below</b>, you will be able to see that I do not have an active POISSON section. SCF steps are converging as normal and my job is going through, so I am not quite sure if I should be worried or disregard the error. I would appreciate any help with interpreting it! Thank you kindly,</span></div><div><span><br></span></div><div><span>Michela<br></span></div><br><div> &GLOBAL<br>   PROJECT_NAME 24h<br>   RUN_TYPE MD<br>   PRINT_LEVEL  LOW<br>   SAVE_MEM  T<br>   PREFERRED_DIAG_LIBRARY ScaLAPACK<br> &END GLOBAL<br> <br> &MOTION<br>   &MD<br>     ENSEMBLE  NPT_I<br>     STEPS  25000<br>     TIMESTEP     0.5<br>     TEMPERATURE     1.2+03<br>     &BAROSTAT<br>       PRESSURE     1.0100000000000000E+00<br>       TIMECON 50<br>       &THERMOSTAT<br>         TYPE  NOSE<br>         &NOSE<br>         TIMECON 50<br>         &END NOSE<br>       &END THERMOSTAT<br>     &END BAROSTAT<br>     &THERMOSTAT<br>       TYPE  NOSE<br>       &NOSE<br>         TIMECON 50<br>       &END NOSE<br>       REGION  GLOBAL<br>     &END THERMOSTAT<br>   &END MD<br>   <br>   &PRINT<br>     &TRAJECTORY  SILENT<br>       &EACH<br>         MD  1<br>       &END EACH<br>     &END TRAJECTORY<br>     &CELL  SILENT<br>       &EACH<br>         MD  1<br>       &END EACH<br>     &END CELL<br>     &VELOCITIES  SILENT<br>       &EACH<br>         MD  1<br>       &END EACH<br>     &END VELOCITIES<br>     &FORCES  SILENT<br>       &EACH<br>         MD  1<br>       &END EACH<br>     &END FORCES<br>     &RESTART  SILENT<br>       &EACH<br>         MD  1<br>       &END EACH<br>     &END RESTART<br>   &END PRINT<br> &END MOTION<br> <br> <br> &FORCE_EVAL<br>   METHOD  QS<br>   STRESS_TENSOR  ANALYTICAL<br>   &DFT<br>     BASIS_SET_FILE_NAME /opt/cp2k/data/BASIS_MOLOPT<br>     POTENTIAL_FILE_NAME /opt/cp2k/data/POTENTIAL<br>     &SCF<br>       MAX_SCF  300<br>       EPS_SCF     1.0000000000000002E-06<br>       SCF_GUESS  ATOMIC<br>       ADDED_MOS  60<br>       &DIAGONALIZATION  T<br>         ALGORITHM  STANDARD<br>       &END DIAGONALIZATION<br>       &SMEAR  T<br>         METHOD  FERMI_DIRAC<br>         ELECTRONIC_TEMPERATURE     1.2000E+03<br>       &END SMEAR<br>       &MIXING  T<br>         METHOD  BROYDEN_MIXING<br>         ALPHA   5.0000000000000002E-02<br>       &END MIXING<br>       &PRINT<br>         &RESTART  OFF<br>         &END RESTART<br>       &END PRINT<br>     &END SCF<br>     &QS<br>       EPS_DEFAULT     1.0000000000000000E-10<br>       EXTRAPOLATION  PS<br>       METHOD  GPW<br>     &END QS<br>     &MGRID<br>       NGRIDS  5<br>       CUTOFF     6.0000000000000000E+02<br>     &END MGRID<br>     &XC #should I add cutoffs?<br>       &XC_FUNCTIONAL  PBE<br>       &END XC_FUNCTIONAL<br>     &END XC<br>   &END DFT<br>   &SUBSYS<br>     &CELL<br>       A     11.452 0 0<br>       B     0 11.452 0<br>       C     0 0 34.356<br>       PERIODIC  XY<br>     &END CELL<br>     &KIND Al<br>       BASIS_SET SZV-MOLOPT-SR-GTH<br>       ELEMENT Al<br>       POTENTIAL GTH-PBE-q3<br>     &END KIND<br>     &TOPOLOGY<br>       COORD_FILE_NAME 64Al.xyz<br>       COORD_FILE_FORMAT  XYZ<br>       NUMBER_OF_ATOMS  64<br>     &END TOPOLOGY<br>   &END SUBSYS<br> &END FORCE_EVAL<br></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9c57c431-0c52-4dab-9f9e-2aaff78fc8ccn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9c57c431-0c52-4dab-9f9e-2aaff78fc8ccn%40googlegroups.com</a>.<br />