I think you may follow this tutorial to calculate vibrational spectroscopy with molecular dynamics:  https://brehm-research.de/spectroscopy.php<br />it is not so simple as just a vibrational analysis of a static  conformation, but it's possible. <br />I hope it helps you. <br /><div><br /><br /></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">Em domingo, 5 de maio de 2024 Ã s 07:23:06 UTC-3, Muhammad Rafiq escreveu:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">so what should i do, which method i use<div><br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Sunday, May 5, 2024 at 6:02:40 PM UTC+8 Marcella Iannuzzi wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">It is not possible to calculate this property with this method for your system with cp2k!<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Sunday, May 5, 2024 at 11:54:24 AM UTC+2 <a rel="nofollow">rafiq...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">(Please check my input file, when i remove the pbc then my system will not treat as periodic) so what should i change in my input please consider my input , thanks for your response<div><br>&GLOBAL<br>  PROJECT MoP100-44-pos-1<br>  PRINT_LEVEL LOW<br>  RUN_TYPE VIBRATIONAL_ANALYSIS<br>&END GLOBAL<br><br>&FORCE_EVAL<br>  METHOD Quickstep<br>  &SUBSYS<br>  Â  &CELL<br>  Â  Â  A Â  Â 12.87500000 Â  Â  0.00000000 Â  Â  0.00000000<br>  Â  Â  B Â  Â  6.43800000 Â  Â 11.15094310 Â  Â  0.00000000<br>  Â  Â  C Â  Â  0.00000000 Â  Â  0.00000000 Â  Â 31.10900000<br>  Â  Â  PERIODIC XYZ <br>  Â  &END CELL<br>  Â  &COORD<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 3.21900000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 3.21900000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 3.21900000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 3.21900000 Â  Â 1.85900000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  0.00000000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  0.00000000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  0.00000000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 12.87500000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 1.85900000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 1.85900000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 1.85900000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 1.85900000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 0.00000000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 4.82800000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 4.82800000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 4.82800000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 4.82800000 Â  Â 4.64600000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  1.60900000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  1.60900000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  1.60900000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 14.48500000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  Â 4.64600000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  Â 4.64600000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  Â 4.64600000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  Â 4.64600000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 2.78800000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 6.43800000 Â  Â 7.43400000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  3.21900000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 9.65600000 Â  Â 7.43400000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  6.43800000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  12.87500000 Â  Â 7.43400000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  9.65600000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  16.09400000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  16.09400000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  16.09400000 Â  Â 7.43400000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  16.09400000 Â  Â 7.43400000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 12.87500000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 12.87500000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 12.87500000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 12.87500000 Â  Â 5.57600000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  10.22200000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  10.22200000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  10.22200000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  Â 8.04700000 Â  10.22200000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 17.70300000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 17.70300000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  4.82800000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  10.22200000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  10.22200000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  10.22200000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  11.26600000 Â  10.22200000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â  8.04700000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  10.22200000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  10.22200000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  10.22200000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  14.48500000 Â  10.22200000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 11.26600000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  17.70300000 Â  10.22200000 Â  Â 1.58700000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  17.70300000 Â  10.22200000 Â  Â 4.76100000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  17.70300000 Â  10.22200000 Â  Â 7.93500000<br>  Â  Â  Mo Â  Â  Â  Â  17.70300000 Â  10.22200000 Â  11.00400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 14.48500000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 0.00000000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 14.48500000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 3.17400000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 14.48500000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 6.34800000<br>  Â  Â  P Â  Â  Â  Â  Â 14.48500000 Â  Â 8.36300000 Â  Â 9.58600000<br>  Â  &END COORD<br>  Â  &KIND Mo<br>  Â  Â  ELEMENT Mo<br>  Â  Â  BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q14<br>  Â  Â  POTENTIAL GTH-PBE<br>  Â  &END KIND<br>  Â  &KIND P<br>  Â  Â  ELEMENT P<br>  Â  Â  BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q5<br>  Â  Â  POTENTIAL GTH-PBE<br>  Â  &END KIND<br>  &END SUBSYS<br><br>  &DFT<br>  Â  BASIS_SET_FILE_NAME Â BASIS_MOLOPT<br>  Â  POTENTIAL_FILE_NAME Â POTENTIAL<br># Â  WFN_RESTART_FILE_NAME MoP100-44-pos-1-RESTART.kp<br>  Â  CHARGE Â  Â 0 <br>  Â  MULTIPLICITY Â  Â 1 <br>  Â  &KPOINTS<br>  Â  Â  SCHEME MONKHORST-PACK Â 3 Â 3 Â 1<br>  Â  &END KPOINTS<br>  Â  &QS<br>  Â  Â  EPS_DEFAULT 1.0E-12 <br># Â  Â  EXTRAPOLATION USE_PREV_P <br>  Â  &END QS<br>  Â  &POISSON<br>  Â  Â  PERIODIC XYZ <br>  Â  Â  PSOLVER PERIODIC <br>  Â  &END POISSON<br>  Â  &XC<br>  Â  Â  &XC_FUNCTIONAL PBE<br>  Â  Â  &END XC_FUNCTIONAL<br>  Â  Â  &VDW_POTENTIAL<br>  Â  Â  Â  POTENTIAL_TYPE PAIR_POTENTIAL<br>  Â  Â  Â  &PAIR_POTENTIAL<br>  Â  Â  Â  Â  PARAMETER_FILE_NAME dftd3.dat<br>  Â  Â  Â  Â  TYPE DFTD3(BJ)<br>  Â  Â  Â  Â  REFERENCE_FUNCTIONAL PBE<br>  Â  Â  Â  Â  #CALCULATE_C9_TERM T <br>  Â  Â  Â  &END PAIR_POTENTIAL<br>  Â  Â  &END VDW_POTENTIAL<br>  Â  &END XC<br>  Â  &MGRID<br>  Â  Â  CUTOFF Â 500<br>  Â  Â  REL_CUTOFF Â 65<br>  Â  &END MGRID<br>  Â  &SCF<br>  Â  Â  MAX_SCF 300<br>  Â  Â  EPS_SCF 1.0E-8 <br># Â  Â  SCF_GUESS RESTART <br># Â  Â  IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE <br>  Â  Â  &DIAGONALIZATION<br>  Â  Â  Â  ALGORITHM STANDARD <br>  Â  Â  &END DIAGONALIZATION<br>  Â  Â  &MIXING <br>  Â  Â  Â  METHOD BROYDEN_MIXING<br>  Â  Â  Â  ALPHA 0.4 <br>  Â  Â  Â  NBROYDEN 8 <br>  Â  Â  &END MIXING<br>  Â  Â  &SMEAR<br>  Â  Â  Â  METHOD FERMI_DIRAC<br>  Â  Â  Â  ELECTRONIC_TEMPERATURE 300 <br>  Â  Â  &END SMEAR<br>  Â  Â  ADDED_MOS Â  Â 64 <br>  Â  Â  &PRINT<br>  Â  Â  Â  &RESTART <br><span style="white-space:pre">       </span>BACKUP_COPIES 0 <br>  Â  Â  Â  &END RESTART<br>  Â  Â  &END PRINT<br>  Â  &END SCF<br>  Â &END DFT<br>&END FORCE_EVAL<br><br>&MOTION<br>  &CONSTRAINT<br>  Â  &FIXED_ATOMS <br>  Â  Â  COMPONENTS_TO_FIX XYZ <br>  Â  Â  LIST 1 2 3 5 6 7 9 10 11 13 14 15 17 18 19 21 22 23 25 26 27 29 30 31 33 34 35 37 38 39 41 42 43 45 46 47 49 50 51 53 54 55 57 58 59 61 62 63 65 66 67 69 70 71 73 74 75 77 78 79 81 82 83 85 86 87 89 90 91 93 94 95 97 98 99 101 102 103 105 106 107 109 110 111 113 114 115 117 118 119 121 122 123 125 126 127<br>  Â  &END FIXED_ATOMS<br>  &END CONSTRAINT<br>  &PRINT<br>  Â  &RESTART<br>  Â  Â  BACKUP_COPIES 0 <br>  Â  &END RESTART<br>  &END PRINT<br>&END MOTION<br>&VIBRATIONAL_ANALYSIS<br>  DX 0.1 <br>  NPROC_REP 60 <br></div><div>  TC_PRESSURE 101325<br>  TC_TEMPERATURE 298.15 <br>  THERMOCHEMISTRY T <br></div><div>  INTENSITIES T <br>  FULLY_PERIODIC T <br>  &PRINT<br>  Â  &MOLDEN_VIB <br>  Â  &END MOLDEN_VIB<br>  &END PRINT<br>&END VIBRATIONAL_ANALYSIS<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Sunday, May 5, 2024 at 5:18:00 PM UTC+8 Marcella Iannuzzi wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi ....<div><br></div><div>This property is calculated only for molecule in gas phase, and not when PBC are used</div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Saturday, May 4, 2024 at 4:27:07 PM UTC+2 <a rel="nofollow">rafiq...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="auto">Like what should I write in input file for thermochemistry calculation?</div><br><div class="gmail_quote"></div><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, 4 May 2024, 9:32 pm Marcella Iannuzzi, <<a rel="nofollow">marci...@gmail.com</a>> wrote:<br></div></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi...<div><br></div><div><br><span style="box-sizing:border-box;font-weight:700;margin:0px 0px 6px;display:table;font-size:14.4px;line-height:normal;background:repeat rgb(231,242,250);color:rgb(41,128,185);border-top-width:3px;border-top-style:solid;border-top-color:rgb(106,176,222);padding:6px;font-family:Lato,proxima-nova,"Helvetica Neue",Arial,sans-serif"><span style="box-sizing:border-box;font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",Courier,monospace;color:rgb(0,0,0)"><span style="box-sizing:border-box">THERMOCHEMISTRY</span></span><em style="box-sizing:border-box;display:inline-block;padding-right:8px;max-width:100%"><span style="box-sizing:border-box"><span style="box-sizing:border-box">:</span></span><span style="box-sizing:border-box"> </span><span style="box-sizing:border-box">logical</span></em><em style="box-sizing:border-box;display:inline-block;padding-right:8px;max-width:100%"><span style="box-sizing:border-box"></span><span style="box-sizing:border-box"><span style="box-sizing:border-box">=</span></span><span style="box-sizing:border-box"> </span><span style="box-sizing:border-box">F</span></em><a href="https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/VIBRATIONAL_ANALYSIS.html#CP2K_INPUT.VIBRATIONAL_ANALYSIS.THERMOCHEMISTRY" title="Link to this definition" style="box-sizing:border-box;color:rgb(64,64,64);display:inline-block;font-weight:normal;font-stretch:normal;line-height:1;font-family:FontAwesome;font-size-adjust:none;font-kerning:auto;font-variant-alternates:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;font-feature-settings:normal;font-size:14.4px;opacity:0;margin-left:0.5em" rel="noreferrer nofollow" target="_blank" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=pt&q=https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/VIBRATIONAL_ANALYSIS.html%23CP2K_INPUT.VIBRATIONAL_ANALYSIS.THERMOCHEMISTRY&source=gmail&ust=1715172722374000&usg=AOvVaw3DwcHduqsb_baP766-h6mn"></a></span><span style="font-size:16px;box-sizing:border-box;margin:0px 0px 12px 24px;line-height:24px;color:rgb(64,64,64);font-family:Lato,proxima-nova,"Helvetica Neue",Arial,sans-serif"><p style="box-sizing:border-box;line-height:24px;margin:0px 0px 12px"><strong style="box-sizing:border-box">Lone keyword:</strong> <span style="box-sizing:border-box;font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",Courier,monospace;font-size:12px;max-width:100%;background-image:none;background-position:0% 0%;background-size:auto;background-repeat:repeat;background-origin:padding-box;background-clip:border-box;border:1px solid rgb(225,228,229);padding:2px 5px;color:rgb(231,76,60);overflow-x:auto"><span style="box-sizing:border-box">T</span></span></p><p style="box-sizing:border-box;line-height:24px;margin:0px">Calculation of the thermochemical data. <b>Valid for molecules in the gas phase.</b></p><p style="box-sizing:border-box;line-height:24px;margin:0px"><br></p><p style="box-sizing:border-box;line-height:24px;margin:0px">Regards</p><p style="box-sizing:border-box;line-height:24px;margin:0px">Marcella</p></span></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Friday, May 3, 2024 at 2:23:20 PM UTC+2 <a rel="noreferrer nofollow">rafiq...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>&VIBRATIONAL_ANALYSIS</div>  DX 0.1 <br>  NPROC_REP 48<br>  TC_PRESSURE 101325 <br>  TC_TEMPERATURE 298.15 <br>  THERMOCHEMISTRY T<br>  FULLY_PERIODIC T<br>&END VIBRATIONAL_ANALYSIS<br><div><br></div><div>Why in output file no thermochemistry? See my output file.</div><div><br></div><div>VIB| Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  142 Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 143 Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 144<br> VIB|Frequency (cm^-1) Â  439.322414 Â  Â  Â  Â  Â  439.460912 Â  Â  Â  Â  Â  445.868786<br> VIB|Red.Masses (a.u.) Â  Â 34.271393 Â  Â  Â  Â  Â  Â 34.269852 Â  Â  Â  Â  Â  Â 34.289785<br> VIB|Frc consts (a.u.) Â  Â  0.003268 Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.003272 Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.003469<br>  ATOM Â EL Â  Â  Â  Â  Â  Â  X Â  Â  Y Â  Â  Z Â  Â  Â  Â X Â  Â  Y Â  Â  Z Â  Â  Â  Â X Â  Â  Y Â  Â  Z Â <br>  Â  Â 3 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.01 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.03 Â  Â -0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  Â 4 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.02 -0.00 -0.03 Â  Â -0.00 Â 0.01 -0.07 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â  Â 8 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.28 Â 0.04 Â 0.00 Â  Â  0.08 -0.17 Â 0.00 Â  Â  0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  11 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.01 -0.00 -0.00 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03 Â  Â -0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  12 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.02 -0.01 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.01 Â 0.07 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â  16 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.28 Â 0.12 Â 0.00 Â  Â -0.08 Â 0.17 -0.00 Â  Â  0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  19 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.01 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.03 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  20 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.02 -0.00 -0.03 Â  Â -0.00 Â 0.01 -0.07 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â  24 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.28 Â 0.04 Â 0.00 Â  Â  0.08 -0.16 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â  27 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.01 -0.00 -0.00 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  28 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.02 -0.01 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.01 Â 0.07 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â  32 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.28 Â 0.12 -0.00 Â  Â -0.08 Â 0.16 -0.01 Â  Â -0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â  35 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 -0.04 Â  Â -0.01 Â 0.00 Â 0.01 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â  36 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 Â 0.08 Â  Â -0.02 Â 0.00 -0.02 Â  Â -0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  40 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.07 Â 0.08 -0.01 Â  Â  0.29 -0.04 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â  43 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.00 Â 0.02 Â  Â  0.01 -0.00 -0.01 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â  44 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 -0.05 Â  Â  0.02 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  48 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.07 -0.24 Â 0.00 Â  Â -0.29 Â 0.04 Â 0.00 Â  Â -0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â  51 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 -0.04 Â  Â -0.01 Â 0.00 Â 0.01 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â  52 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 Â 0.08 Â  Â -0.02 Â 0.00 -0.02 Â  Â  0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  56 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.07 Â 0.08 -0.01 Â  Â  0.29 -0.04 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.00 Â 0.25<br>  Â  59 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.00 Â 0.02 Â  Â  0.01 -0.00 -0.01 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â  60 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 -0.05 Â  Â  0.02 -0.00 Â 0.02 Â  Â  0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  64 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.07 -0.24 Â 0.00 Â  Â -0.29 Â 0.04 -0.00 Â  Â  0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  67 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.01 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.03 Â  Â -0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  68 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.02 -0.00 -0.03 Â  Â -0.00 Â 0.01 -0.07 Â  Â  0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  72 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.27 Â 0.04 Â 0.00 Â  Â  0.07 -0.17 Â 0.00 Â  Â  0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  75 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.01 -0.00 -0.00 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  76 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.02 -0.01 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.01 Â 0.07 Â  Â -0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  80 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.27 Â 0.12 Â 0.00 Â  Â -0.07 Â 0.17 -0.00 Â  Â  0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  83 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.01 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.03 Â  Â -0.00 -0.00 -0.03<br>  Â  84 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.02 -0.00 -0.03 Â  Â -0.00 Â 0.01 -0.07 Â  Â -0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  88 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.27 Â 0.04 Â 0.00 Â  Â  0.07 -0.17 Â 0.00 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  91 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.01 -0.00 -0.00 Â  Â  0.00 -0.00 -0.03 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â  92 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.02 -0.01 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.01 Â 0.07 Â  Â  0.00 -0.00 -0.05<br>  Â  96 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.27 Â 0.12 -0.00 Â  Â -0.07 Â 0.17 -0.00 Â  Â -0.00 Â 0.00 Â 0.24<br>  Â  99 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 -0.04 Â  Â -0.01 Â 0.00 Â 0.01 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â 100 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 Â 0.08 Â  Â -0.02 Â 0.00 -0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â 104 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.07 Â 0.08 -0.01 Â  Â  0.29 -0.04 -0.00 Â  Â -0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â 107 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 Â 0.02 Â  Â  0.01 -0.00 -0.01 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â 108 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 -0.05 Â  Â  0.02 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â 112 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.07 -0.24 Â 0.00 Â  Â -0.29 Â 0.04 -0.00 Â  Â -0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â 115 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 -0.04 Â  Â -0.01 Â 0.00 Â 0.01 Â  Â -0.00 -0.00 -0.03<br>  Â 116 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  -0.00 -0.00 Â 0.08 Â  Â -0.02 Â 0.00 -0.02 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.05<br>  Â 120 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.07 Â 0.08 -0.00 Â  Â  0.29 -0.05 Â 0.00 Â  Â  0.00 -0.00 Â 0.24<br>  Â 123 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 Â 0.02 Â  Â  0.01 -0.00 -0.01 Â  Â  0.00 Â 0.00 -0.03<br>  Â 124 Â Mo Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.00 Â 0.01 -0.05 Â  Â  0.02 -0.00 Â 0.02 Â  Â -0.00 -0.00 -0.05<br>  Â 128 Â P Â  Â  Â  Â  Â  Â -0.07 -0.24 Â 0.00 Â  Â -0.29 Â 0.05 -0.00 Â  Â  0.00 -0.00 Â 0.24<br><br><br><br> -------------------------------------------------------------------------------<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  -<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â DBCSR STATISTICS Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  -<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  -<br> -------------------------------------------------------------------------------<br> COUNTER Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â TOTAL Â  Â  Â  BLAS Â  Â  Â  SMM Â  Â  Â  ACC<br> flops inhomo. stacks Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> flops total Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.000000E+00 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> flops max/rank Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 0.000000E+00 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> matmuls inhomo. stacks Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> matmuls total Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 0 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> number of processed stacks Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0 Â  Â  Â  0.0% Â  Â  Â 0.0% Â  Â  Â 0.0%<br> average stack size Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.0 Â  Â  Â  0.0 Â  Â  Â  0.0<br> marketing flops Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  0.000000E+00<br> -------------------------------------------------------------------------------<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  -<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â DBCSR MESSAGE PASSING PERFORMANCE Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â -<br> - Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  -<br> -------------------------------------------------------------------------------<br> ROUTINE Â  Â  Â  Â  Â  Â  CALLS Â  Â  Â AVE VOLUME [Bytes]<br> MP_Bcast Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 1 Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  12.<br> MP_Allreduce Â  Â  Â 1316782 Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â 8.<br> MP_Alltoall Â  Â  Â 12045666 Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  Â  733641.<br> -------------------------------------------------------------------------------<br><br></div></blockquote></div>

<p></p></blockquote></div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a rel="noreferrer nofollow">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/60f3a959-3150-421a-b591-4538d437b6b6n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer" rel="noreferrer nofollow" target="_blank" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=pt&q=https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/60f3a959-3150-421a-b591-4538d437b6b6n%2540googlegroups.com?utm_medium%3Demail%26utm_source%3Dfooter&source=gmail&ust=1715172722375000&usg=AOvVaw1I8khBNteu1hlBb-UZQ_i7">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/60f3a959-3150-421a-b591-4538d437b6b6n%40googlegroups.com</a>.<br>
</blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/d983e913-9e30-4bff-8c27-838a3cf36f54n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/d983e913-9e30-4bff-8c27-838a3cf36f54n%40googlegroups.com</a>.<br />