Dear cp2k users,<div><br /></div><div><div style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: small;">I am trying to perform AIMD of ferrocene in vacuum. I added a ghost atom in the centre of the benzene and connected it to the Fe atom; the coordination of the ghost atom is (8.68, 13.71, 10.92). But throughout the MD process, except the first configuration in the trajectory file, the ghost atom is at the positionĂ‚ of (0,0,0). I tried to fix the ghost atom using "FIXED_ATOMS" and "COLVAR/DISTANCE" to constrain the, but it failed. Does some have idea to that to fix the ghost atom in the center of the benzene?<br /></div><div style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: small;"><br /></div><div style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: small;"><br /></div><div style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: small;">Regards,</div><div style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: small;">Jay</div></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/0b0fab3b-2866-4a08-bad3-2f7d6d2c409cn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/0b0fab3b-2866-4a08-bad3-2f7d6d2c409cn%40googlegroups.com</a>.<br />