Hi,<div><br /></div><div>I don't know about Q1 but if you mean <span style="font-size: 14.000001px;">*-pos.xyz file</span><span style="font-size: 14.000001px;"> by output file, you </span><span style="font-size: 14px;">can ask to print the atomic kind rather than the element by </span></div><div><br /></div><div><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">&MD</span></p><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">  &PRINT</span></p>
<p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">    &TRAJECTORY</span></p>
<p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">      PRINT_ATOM_KIND T</span></p><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">...</span></p><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;"><br /></span></p><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;"><br /></span></p><p style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 12px; line-height: normal; font-family: Menlo; font-size-adjust: none; font-kerning: auto; font-variant-alternates: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-east-asian: normal; font-variant-position: normal; font-feature-settings: normal; font-optical-sizing: auto; font-variation-settings: normal; color: rgb(0, 0, 0);"><span style="color: rgba(0, 0, 0, 0.87); font-family: Roboto, RobotoDraft, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 14px;">this will give you the *-pos.xyz file with the kind name you specified. and in any case, in the standard cp2k output you should see that </span><span style="color: rgba(0, 0, 0, 0.87); font-family: Roboto, RobotoDraft, Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: 14.000001px;">different numbers are assigned for each kind and this is what is printed under e.g. charges. For example, your kind CF1 will be kind 1 and CF2 will be kind 2, but they will keep the element name C.</span><br /></p></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Thursday 21 March 2024 at 08:55:32 UTC+1 zw wang wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hi<div>I'm trying to perform AIMD with a constraining system. In order to distinguish the constraining atoms(name CF1) with the same element (C), I changed the name of the constraining atoms. I met some problem about it.</div><div>Q1：I've found that cp2k can only constrain atoms with atomic index. Can cp2k constrain atoms with atomic name? if it can do it, how to set it?</div><div>Q2:   Why did I set the different atomic names(CF1) when I didn't keep them in output file, and they became the element names(C)?<br></div><div>The input and output are attached.<br></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/f6b161f1-ffac-45af-894e-e4aa922a0edbn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/f6b161f1-ffac-45af-894e-e4aa922a0edbn%40googlegroups.com</a>.<br />