Dear cp2k users,<div><br /></div><div>I simulated optimization of the MOF structure by periodic boundary conditions DFT .</div><div><br /></div><div>When I performed the calculation with the cell size in the cif file such as cif file and before picture, all atoms was be included in the cell.<br /></div><div><br /></div><div>How should the cell size or initial condition be set when calculating such a unit cell?<br /></div><div>Should the calculation be done  by using the input file composed of atoms only in the unit cell?<br /></div><div><br /></div><div>The input and cif file are attached below,</div><div>and the snapshot before and after calculation are attached</div><div><br /></div><div>Many thanks,</div><div>K.AK</div><div><br /></div><div><img alt="before.png" width="534px" height="295px" src="cid:0c54fb35-0d86-49cb-ad42-d78236fcc091" /><img alt="after.png" width="534px" height="266px" src="cid:8d21397f-5812-44e2-96c7-f6fb22f5ecd8" /><br /></div><div><br /></div><div><br /></div><div><br /></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ec990341-003a-4603-b014-c188ecc71796n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ec990341-003a-4603-b014-c188ecc71796n%40googlegroups.com</a>.<br />