<div>Hi Karl!</div><div><br /></div><div>If you have no experience whatsoever with running MD simulations, maybe the easiest way would be a collaboration with someone knowledgeable within this area.<br /></div><div><br /></div><div>To answer your first question, there is a good <a href="https://www.cp2k.org/exercises:2015_cecam_tutorial:mtd1">tutorial</a> online for running Metadynamics within cp2k.</div><div>It is also possible and efficient to run normal MD to obtain an equilibrized trajectory from which good initial structures of your system can be sampled. Producing a quality MD trajectory  is not entirely trivial, especially if the system is large and complex. There are many resources and books on this topic, however. A resource which is popular within our group is the "Understanding Molecular Simulations" by Daan Frankel & Berend Smit.</div><div><br /></div><div>Off-topic note: Thank you for all your work on cross section computations at NIST! I have had great use of your results for the past few years. :)</div><div><br /></div><div>Best,</div><div>André<br /></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Thursday 11 January 2024 at 13:47:07 UTC+1 Marcella Iannuzzi wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hello Karl<div><br></div><div>The same time of simulations as in [doi: 10.1021/acs.jpcb.5b05211] are possible with CP2K</div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, January 10, 2024 at 4:02:41 PM UTC+1 <a href data-email-masked rel="nofollow">karl.i...@nist.gov</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear CP2K experts,<div><br></div><div>I would like to learn how to do computations like those described in [doi: 10.1021/acs.jpcb.5b05211]. I would like to study the effect of pressure.  Is this possible using CP2K?  </div><div><br></div><div>If it is, can you suggest how I should learn the technical part?  Unfortunately I have no experience with either MD or PBC-electronic structure. </div><div><br></div><div>Thanks for any advice,</div><div>Karl</div><div><br></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2aea03f9-32d6-4c9f-a84d-3023c2448facn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2aea03f9-32d6-4c9f-a84d-3023c2448facn%40googlegroups.com</a>.<br />