Hi,<div><br /></div><div>I was trying to simulate two water molecules AIMD in a cubic box.</div><div><br /></div><div>My input xyz file:</div><div>6<br />Lattice="10.0 0.0 0.0 0.0 10.0 0.0 0.0 0.0 10.0"  pbc="T T T"<br />O        4.37550000       3.77930000       5.10020000        0<br />H        5.31560000       3.58750000       5.05620000        1<br />H        4.33320000       4.74320000       5.18240000        2<br />O        4.23470000       6.68560000       5.28660000        3<br />H        3.78920000       7.02380000       6.06950000        4<br />H        3.75480000       7.07300000       4.54800000        5<br /></div><div>My .inp file:</div><div>  &SUBSYS<br />    &CELL<br />      A 10 0 0<br />      B 0 10 0<br />      C 0 0 10<br />    &END CELL<br />    &TOPOLOGY<br />      COORD_FILE_NAME wd.xyz<br />      COORD_FILE_FORMAT XYZ<br />    &END TOPOLOGY<br />    &KIND O<br />      BASIS_SET DZVP-GTH<br />      POTENTIAL GTH-PBE-q6<br />    &END KIND<br />    &KIND H<br />      BASIS_SET DZVP-GTH<br />      POTENTIAL GTH-PBE-q1<br />    &END KIND<br />  &END SUBSYS<br /></div><div><br /></div><div>I want to constrain two water molecules inside a box (10x10x10). But my output the trajectory file XX-pos-1.xyz didn't show the box and two water molecules fly apart far beyond the &CELL size.</div><div><br /></div><div>How to change input parameters to fix this?</div><div><br /></div><div>Thanks!</div><div><br /></div><div><br /></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/1c37ff1a-addc-4a24-9257-598506008409n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/1c37ff1a-addc-4a24-9257-598506008409n%40googlegroups.com</a>.<br />