<div></div><div>Good day.<br /></div><div>I am exploring molecular dynamics under field.</div><div></div><div></div><div>I set glycine at the center of a box,</div><div>and suggested Ehrenfest dynamics with a time step of about 0.04 fs,</div><div>while the custom field file sets the external field to ZERO. <br /></div><div></div><div></div><div>The simulation proceeds alright, till the time-frame 500, after which</div><div>there is a peculiar structural "expansion".</div><div></div><div><b>Q1: Would you comment this?</b></div><div></div><div>Also, I attach a fragment of the momentum file:</div><div>CP2K prints reference point position to be "chaotic",</div><div>while I select 
REFERENCE COAC: since the atomic charges of the glycine, <br /></div><div>the reference point should be next to the C-alpha atom. <br /></div><div></div><div>
<b>Q2:  would you comment on the usage of the setting I selected?  </b><b><br /></b></div><div></div><div>Thank you.</div><div>Victor<br /> </div><div><br /></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/fb9785e7-ccbb-4154-88b3-b5e998dfd5e8n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/fb9785e7-ccbb-4154-88b3-b5e998dfd5e8n%40googlegroups.com</a>.<br />