<div dir="ltr">For user-defined input, I have used these files and the command specified at the end of the page. <div><a href="https://github.com/bioexcel/qmmm_benchmark_suite/tree/master/CBD_PHY/GMX_CP2K">https://github.com/bioexcel/qmmm_benchmark_suite/tree/master/CBD_PHY/GMX_CP2K</a><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Mar 29, 2023 at 2:08 PM Gayatri Panda <<a href="mailto:gayatrip@iiitd.ac.in">gayatrip@iiitd.ac.in</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>I have a query in the Gromacs-CP2K tutorial.
</div><div></div><div><a href="https://docs.bioexcel.eu/2021-04-22-qmmm-gromacs-cp2k/05-gmx+cp2k/index.html" rel="noopener nofollow noreferrer" target="_blank">https://docs.bioexcel.eu/2021-04-22-qmmm-gromacs-cp2k/05-gmx+cp2k/index.html</a>
After running step 4, I am not getting inp and pdb files as output. </div><div>Even though I tried to follow this tutorial by defining user input, this also failed and gave this error </div><div>"System I/O error:</div>Could not open file 'CBD_PHY/_cp2k.inp'<br>  Reason: No such file or directory<br>  (call to fopen() returned error code 2)<br><div>". I am very new to CP2K and QM/MM simulations; your guidance will be highly appreciated. </div><div><br></div>Thanks and regards<br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><b><i>Gayatri Panda</i></b><div><b>PhD19206 (Computational Biology)</b></div><div><br></div><div><br></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><b><i>Gayatri Panda</i></b><div><b>PhD19206 (Computational Biology)</b></div><div><br></div><div><br></div></div></div></div></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CAAkrUfd_WRAZtUw4PxjPspf5RiBnSAhMnwNNQfx%3D25%2B69SseUA%40mail.gmail.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CAAkrUfd_WRAZtUw4PxjPspf5RiBnSAhMnwNNQfx%3D25%2B69SseUA%40mail.gmail.com</a>.<br />