<div><br /></div><div>Dear ...</div><div><br /></div><div>These are quite general questions about metadynamics, not specifically related to cp2k.</div><div>My first suggestion is that you refer to reviews, tutorials, books about the method in general, before starting using it.</div><div><br /></div><div>1 and 2 are strongly system dependent and the usual advise is to learn the behaviour of the system by running molecular dynamics and monitoring the fluctuations of the variables of interest.</div><div>Number 3 is wrongly posed. Once convergence is reached, the relative differences in free energies should not change anymore.</div><div><br /></div><div>Regards</div><div>Marcella</div><br /><br /><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, March 21, 2023 at 8:14:16 AM UTC+1 Himangshu Pratim Bhattacharyya wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div>Dear developers and users of <span>CP2K</span></div><div><br></div><div>I am carrying out a metadynamic simulation with the collective variable, <b>CV1 =  O-O bond formation process</b>, and <b>CV2=  proton transfer reaction</b>. For my simulation both processes are not seen distinctly. only for CV1, I found the continuous with two peaks. However, along CV2,  I have not seen any contour for the reaction dynamics? The plots have been attached here for your reference. <br></div><div><br></div><div>Further, can anyone kindly help me out in answering the following questions</div><div><b><br></b></div><div><b>1) How to choose the reference values for metadynamic simulation?</b></div><div><b><br></b></div><div><b>2) How to choose NN and ND values for metadynamic simulation? Current case I consider NN and ND values 8 and 12 respectively.<br></b></div><div><b><br></b></div><div><b>3) Does the FES depend upon the run time of simulation?</b></div><div><br></div><div>I hope the developers and users of <span>CP2K will be kind enough to help me out. <br></span></div></div>
</blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2cbbdf50-11b5-4523-ab33-5318175db33dn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2cbbdf50-11b5-4523-ab33-5318175db33dn%40googlegroups.com</a>.<br />