More information is that the Amber force field parameter that I used, has been minimized to a convergence structure.<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">taiping zhou 在 2022年11月27日 星期日上午10:44:43 [UTC+8] 的信中寫道：<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hello,everyone.<div>      

When I was minimizing cp2k, the distance between the normal histidine N and the water next to it changed from 1.0A to 0.3A, which then caused the simulation failure. 

I have tried to add the LJ parameter of water molecule, and there are multiple histidine (HID or HIE) in this situation.  How can I solve it?</div><div><br><div>  <img alt="QQ图片20221127104412.png" width="536px" height="140px" src="https://groups.google.com/group/cp2k/attach/4fbb57c9b1460/QQ%E5%9B%BE%E7%89%8720221127104412.png?part=0.1&view=1"></div></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2ee001e5-6095-49d5-b658-8acf7de98227n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2ee001e5-6095-49d5-b658-8acf7de98227n%40googlegroups.com</a>.<br />