Hi<div><br></div><div>According to the input that you posted the calculation is restarted from ${FILERESTART}</div><div>Velocities and thermostat should also be restarted from the value in that file, hence the temperature.</div><div>To avoid that, you can use RESTART_VEL FALSE</div><div>Regards</div><div>Marcella</div><div><br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Friday, November 4, 2022 at 7:03:20 PM UTC+1 Kamil wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div>Dear developers, <br></div><div><br></div><div>I have a problem 
regarding QM/MM simulation of biochemical system - after preparation and equilibration
 in AMBER I started QM/MM in cp2k, however I noticed strange behaviour:</div><div><br></div><div>i)
 velocities are initialized for the temperature ca. 207 K - it's 
strange, because in the input file temperature is set to ca. 300K,</div><div><br></div><div>ii) for every restart initialization is performed again at 207K...<br></div><div><br></div><div>What can be the cause of that behaviour? <br></div><div><br></div><div>P.S. My input file is in the attachment. <br></div><div><br></div><div>Best regards<br><br></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ab133760-95b6-440b-9c02-95cd539b1faan%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/ab133760-95b6-440b-9c02-95cd539b1faan%40googlegroups.com</a>.<br />