Hi Dr. Iannuzzi,<div><br></div><div>Thank you so much for the reply and for clearing up my confusion. That would be a very nice feature indeed I may work on that! Thanks again and have a great day!</div><div><br></div><div>Sincerely,</div><div>Woody<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, October 12, 2022 at 1:56:21 AM UTC-5 Marcella Iannuzzi wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hallo Woody<div><br></div><div>The argument -espot of cubecruncher is something very specialised for getting an electrostatic potential map on top of a STM 2D topography.</div><div>It is not generalised for a 3D map. If you want to generalise to 3D you should introduce a new feature in cubecruncher.</div><div><br></div><div>Kind regards</div><div>Marcella</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, October 11, 2022 at 11:29:16 PM UTC+2 <a href data-email-masked rel="nofollow">saxophone....@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Hello everyone,</div><div><br></div><div>I am trying to make an electrostatic potential map of a molecule. After obtaining the electrostatic potential and electron density CUBE files from CP2K, and after processing the cube files with <br></div><div>" $ cubecruncher.x -i cp2k-ELECTRON_DENSITY-2.cube -espot_cube cp2k-v_hartree-2.cube -espot -o edensity_pot.cube ", the resulting cube file is not the electrostatic potential map that I was expecting. I've attached the CP2K input file I was using as well as a screenshot of me trying to visualize the cube file generated by cubecruncher in VESTA. Is there something I am doing wrong or do I need additional information? Any help would be much appreciated. Thanks!</div><div><br></div><div>Sincerely,</div><div>Woody<br></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/3e9de4a0-b568-4f45-b6e4-2f4d6540015cn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/3e9de4a0-b568-4f45-b6e4-2f4d6540015cn%40googlegroups.com</a>.<br />