<div>Dear all,</div><div>I am good with running all-atom MD simulations of biomolecular complexes, however, now I want to study the reaction mechanism of an enzyme-substrate complex through QM/MM simulation.</div><div><br></div><div>Please, can I anyone guide as where to start for:</div><div>1. installing software for QM/MM (cp2k)</div><div>2. integrating cp2k with gromacs</div><div>3. installing important dependencies</div><div>4. what parameters are important to be considered</div><div>5. how to define QM boundary<br></div><div>6. how to initiate first QM/MM simulation</div><div><br></div><div>Thank you in anticipation.</div><div>-Amiruddin<br></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/152ce6c7-7734-4c75-b6d0-09031d246d05n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/152ce6c7-7734-4c75-b6d0-09031d246d05n%40googlegroups.com</a>.<br />