Dear Meili<div>To add to Marcella's point, state 1 is not disappeared. Free energy is calculated from the statistics which is changing as simulation time increases.</div><div>You should continue the simulation until you see convergence in the free energy profile. </div><div>Regards</div><div>Shreya</div><div><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Thursday, August 25, 2022 at 10:10:01 PM UTC+5:30 Marcella Iannuzzi wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div><br></div><div>Dear Meili</div>It is not a good idea comparing contour plots using different color scales.<div>The sampling has simply spent more time in other regions and the relative energy difference changes with time.</div><div>Regards</div><div>Marcella</div><div><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Thursday, August 25, 2022 at 6:29:49 PM UTC+2 <a href data-email-masked rel="nofollow">meilil...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear all,<div><br></div><div>I am using coordination number as collect variable (CN1, CN2) to run Well-T Metadynamics simulation with CP2K. 0-16ps simulation looks fine. However, as the simulation time goes, the initial state disappeared.(Showed in picture 1.) Why it will happened to disapper and how to understand this situation?</div><div><br></div><div>Thanks in advance.</div><div><br></div><div>Best</div><div>Meili</div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/6d541bf5-1c9c-40b6-8951-dca608841aadn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/6d541bf5-1c9c-40b6-8951-dca608841aadn%40googlegroups.com</a>.<br />