Dear Marcella,<div><br></div><div>Thanks! will the FES tool correct for the external potential when I use it to calculate the free energy profile? <br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, July 27, 2022 at 12:18:29 AM UTC+8 Marcella Iannuzzi wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Dear  ..<div><br></div><div>Yes an external potential is going to affect the sampling, hence the probability distribution, consequently the estimate of free energy differences. </div><div><br></div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Monday, July 25, 2022 at 10:01:21 AM UTC+2 <a href data-email-masked rel="nofollow">alh...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear all, <div><br></div><div>I would like to study a surface reaction using metadynamics. I built up a  box of water and placed my reactants on the surface of the box. when I run MD, the reactants always flee to vacuum (gas phase). I want to apply an external potential to my reactants so that they stay at the surface.</div><div><br></div><div>Question: would this affect my free energy calculation? Or the CP2K package has a way to correct for the external potential when calculating the free energy?  Thanks.</div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9ac3e3d8-1271-4a55-83b0-311ec77488a4n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9ac3e3d8-1271-4a55-83b0-311ec77488a4n%40googlegroups.com</a>.<br />