đź‘Ť<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, 20 July 2022 at 10:34:22 UTC+1 wangch...@gmail.com wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Dear Mat,<div><br></div><div>Thank you so much for the reply. </div><div><br></div><div>I tried a lot but none of them works. So I re-compiled cp2k and now it looks fine ~</div><div><br></div><div>Restart and recompile are the most useful strategies, lol ~</div><div><br></div><div>Best</div><div>Jessie</div><div><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, July 19, 2022 at 7:20:38 PM UTC+8 <a href data-email-masked rel="nofollow">mattwa...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello,<div>without full setup we can't completely reproduce your problem.</div><div>The slowdown sounds like a memory leak - this is unlikely to come from CP2K itself as it is pretty well tested for such calculations. </div><div>The later message suggests that your MPI setup might be causing the problem. Do you have different MPI environments on your cluster you could try or are there FAQs with common problems that might suggest a solution?</div><div>You could try just running without MPI using a cp2k.ssmp executable and see if the memory problem went away.</div><div>Without full details probably can't say anything else. I'd suggest talking to your cluster support and see if they can suggest something.</div><div>Matt<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, 19 July 2022 at 12:02:08 UTC+1 <a rel="nofollow">wangch...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Another failed apears~<div><br><img alt="QQ20220719-190139@2x.png" width="742px" height="492px" src="https://groups.google.com/group/cp2k/attach/1a54f9b04ff93/QQ20220719-190139@2x.png?part=0.1&view=1"><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Tuesday, July 19, 2022 at 6:24:21 PM UTC+8 Jessie wang wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear All,<div><br></div><div>I am performing a geometry optimization of a Au cluster by 1 node, 96 core, Â using PBE and DZVP-MOLOPT-SR-GTH. I think this should be a simple process, but it went wrong. <br><br>At the beginning it went well and each SCF step took 7~8s and SCF converged very fast. But after 1-2 hours it became very slow, each SCF step took several hundred seconds and the 3000s. And finally it went down. I tried it several times until I noticed that the memory occupied by cp2k was increasing linearly, i.e. it never released the memory. <br><br>I tried cp2k9.1 and cp2k8.3, all went wrong.I’m really confused and don’t know what to do.<br><br>I am really appreaciate it if you can help me with this problem.<br></div><div><br></div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Jessie</div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/07c532be-946e-46cc-a412-c3d88bada89cn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/07c532be-946e-46cc-a412-c3d88bada89cn%40googlegroups.com</a>.<br />