<div dir="ltr">Dear Jessie,<div><br></div><div>maybe the coordinates that you give as input are not in the correct units (angstrom / bohr). You also don't specify the units in the cell section. </div><div>I would check this first to make sure that the cell vectors and the coordinates have the correct units.</div><div><br></div><div>Best regards</div><div><br></div><div>Anna</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Am Do., 7. Juli 2022 um 11:22 Uhr schrieb Jessie wang <<a href="mailto:wangchuyan123@gmail.com">wangchuyan123@gmail.com</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear all,<div><br></div><div>I am new to cp2k and am performing a test geometry optimization.</div><div>  <br>The initial geometry is actually the result of Gaussian's geometry optimization. So the initial input of the structure should be reasonable enough for cp2k to run and converge in a short time. </div><div><br></div><div>But it displays "WARNING in particle_methods.F:684 :: The distance between the atoms *** *** 10 and 405 is only 0.496 angstrom  smaller than the threshold *** *** of 0.500 angstrom " a lot. And the program seems to be stuck in a weird corner and not updating anything in the output, but it keeps running on the server. I here attached the inp and out file here.<img alt="WechatIMG224.jpeg" width="534px" height="465px" src="cid:208d368f-3cbd-4bb4-9cef-fc00fcbfbdf9"></div><div><br></div><div>I'm appreciate it if you can help me with this or provide any information refers to the problem.</div><div><br></div><div>Thank you !!</div>

<p></p>

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com" target="_blank">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br>
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/955838ca-3cee-489d-9ca8-90f0bae8ad9an%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer" target="_blank">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/955838ca-3cee-489d-9ca8-90f0bae8ad9an%40googlegroups.com</a>.<br>
</blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CACM8JBnp5bPJryST0qPkyqV5T4XPJLXBUHd5YEEz%2BurD6zjx_Q%40mail.gmail.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CACM8JBnp5bPJryST0qPkyqV5T4XPJLXBUHd5YEEz%2BurD6zjx_Q%40mail.gmail.com</a>.<br />