Hi Ivan, did you manage to get PM6-FM method to work with PBC? I have also the same problem of broken O..H bonds.<div>Ruel<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Thursday, September 30, 2021 at 1:19:32 PM UTC+2 igladi...@gmail.com wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><p>Dear CP2K users</p><p> I would like to perform a bulk water simulation using PM6-FM semiempirical method. My goal is to have a flavor of a chemical reaction between organics in bulk water and, afterward, refine it at DFT-MD level.</p><p>I am a newbie on semiempirical methods. I used PM6-FM because it seems appropriate for liquid system</p><p>(<a href="https://groups.google.com/g/cp2k/c/BjBMWoq0doE/m/QADgmxMhAQAJ" style="text-decoration:underline" target="_blank" rel="nofollow" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=en&q=https://groups.google.com/g/cp2k/c/BjBMWoq0doE/m/QADgmxMhAQAJ&source=gmail&ust=1655108733284000&usg=AOvVaw2VCVllLDxpVWSeeTjZlH4G">https://groups.google.com/g/cp2k/c/BjBMWoq0doE/m/QADgmxMhAQAJ</a> )</p><p> I started inspired by some examples in CP2k github. I made two attempts, but both give me unreasonable results</p><p> 1)    A water cluster in vacuum at 300 K. After a short while, the system "kind of freezes" and nothing is moving</p><p> 2)    A bulk water box in PBC: after a short while all hydrogens detach from the water oxygen</p><p> Thus, Is it possible to perform semiempirical  (PM6-FM or other) MD in full PBC? Does anyone have a successful input to share or point that  I can use as a starting point?</p><p> I attach my inputs if someone is interested to check.</p><p>The initial configuration was taken from an equilibrated water box of 1.9 nm X 1.9nm X 1.9nm equilibrated at  classical MD at 1 bar and 300 K</p><p> Thank you very much for any possible help or suggestion</p><p>Best regards</p><p>Ivan</p></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/b8cda270-55da-4387-9831-1e07199f91b8n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/b8cda270-55da-4387-9831-1e07199f91b8n%40googlegroups.com</a>.<br />