<div>Dear CP2K community</div><div><br></div><div>I am seeing some odd behavior with the hydrogen on a couple of molecules. I think it is something to do with periodic boundary interactions, and I was wondering if there was a way to minimize initial positions. I don't have classical MD parameters ready, as I am running it AIMD, but I can assign GAFF values and run it a round through amber minimization I guess, but I don't know if CP2K can take amber output. Any guidance would be much appreciated. </div><div><br></div><div>With best wishes</div><div>Eric</div><div><br></div><div><br></div><img alt="Screen Shot 2022-05-12 at 10.56.06 AM.png" data-iml="69676" width="534px" height="368px" src="cid:2dfa1381-5ae8-4f85-81b9-9de4e13bce48"><br><div><br></div><div><br></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/d54c687d-10c8-40bf-bf53-cbf7aa3132aan%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/d54c687d-10c8-40bf-bf53-cbf7aa3132aan%40googlegroups.com</a>.<br />