<div>I see. Thanks Marcella!</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Alex<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Monday, 21 March 2022 at 17:06:33 UTC-4 Marcella Iannuzzi wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Dear Alex, <div><br></div><div>The TEMP_TOL  keyword in the metadynamics section might become useful to better control the dynamics of the auxiliary variables, when the Lagrangian scheme is used. <br>Best</div><div>Marcella</div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Monday, March 21, 2022 at 6:05:16 PM UTC+1 <a href data-email-masked rel="nofollow">alexbro...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Marcella,<br><br><div>Thanks a lot for your response. <br></div><div><br></div><div>I have one more confusion if you can help. I saw two TEMP_TOL keywords in metadynamics, the other one in the METADYN section. Do I need to specify the <b>TEMP_TOL</b> keyword in both <b>MD</b> and <b>METADYN</b> section to keep the temperature of the auxilary variables close to the real system or just specifying in <b>METADYN</b> section is fine. <br></div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Alex<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Monday, 21 March 2022 at 10:00:10 UTC-4 Marcella Iannuzzi wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear Alex<div><br></div><div>The message from CP2K is a warning and not an error message. </div><div><br></div><div>It is in general  OK  to run equilibration with TEMP_TOL active.</div><div>It is not OK to extract ensemble averages from trajectories generated with active TEMP_TOL.</div><div>It is instead  OK and sometimes recommended to run metadynamics with TEMP_TOL to avoid heating up the system.</div><div><br></div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Saturday, March 19, 2022 at 9:11:23 PM UTC+1 <a rel="nofollow">alexbro...@gmail.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div>Dear Cp2k users and developers,</div><div><br></div><div>I am a new to the code cp2k. I am trying to perform an AIMD & Metadynamics simulation and came across this keyword <b>TEMP_TOL</b> in the <b>MD</b> section. <br></div><div><br></div><div>If I include it, I see error message in the output file saying "Keyword TEMP_TOL was used and jumps may appear in the conserved quantity". If I don't include it, I see temperature going way higher than the target temperature during initial the MD steps. <br><br>Can anyone guide me on this? What is the best practice to perform a successful AIMD for equilibration? PFA my input file for reference.<br></div><div><br></div><div>Best Regards,</div><div>Alex Brown<br></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2ad8e4e5-d67d-42d9-b36c-e75d02cca28bn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/2ad8e4e5-d67d-42d9-b36c-e75d02cca28bn%40googlegroups.com</a>.<br />