Hi Sumit<br>Not really sure what you are asking. The really large values are the integral of the middle column, so it's not surprising that it's a big number.<br>It's the spectrum column (middle one of three) vs. wavenumber that would be the IR spectrum.<div>Best</div><div>Sam<br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Wednesday, November 10, 2021 at 2:11:53 PM UTC+1 sumitag...@gmail.com wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>Any suggestions? How I can plot the IR spectra from above outputs. </div><div><br></div><div>Thanks</div><div>Sumit</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, Nov 6, 2021 at 10:24 AM sumit agrawal <<a href data-email-masked rel="nofollow">sumitag...@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hii everyone,<br><div><br></div><div>I have done the MD in cp2k to calculate vibrational spectra of methanol. My calculation is done for MD, and I am using TRAVIS to analyse the trajectory. The trajectory file is " <a href="http://methanol_wannier.xyz/" target="_blank" rel="nofollow" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=en&q=http://methanol_wannier.xyz/&source=gmail&ust=1645201886154000&usg=AFQjCNHV-zJKdUy_EQn8QHvmRAfJKtufnw">methanol_wannier.xyz</a>" and after using TRAVIS I obtain 4 files which are given below. Now in #1#ir_spectrum_CH4O and #1#ir_spectrum_global there are entries only in X column other having 0 values and ir_spectrum_global, ir_spectrum_CH4O have both the values but Y having very large values (is it noise or something problem with my trajectory ?).</div><div><br></div><div>Now my question is which files I have to consider for the IR plot and how to plot IR spectra. Because in one case Y having 0 values and in the other case Y having very large values.</div><div><br></div><div><br></div><div>I also attached the input file for this MD run.</div><div><br></div><div>Please help me in this regard.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>sumit</div></div>
</blockquote></div>
</blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/328ed631-8f21-47bc-b672-7eb89befeb64n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/328ed631-8f21-47bc-b672-7eb89befeb64n%40googlegroups.com</a>.<br />