Dear CP2K community,<div>I am running a molecular dynamics simulation for a system containing an ion and triphosphate.</div><div>I need to avoid the center of mass of triphosphate to go further than 6.5 A away from the ion, but I need to sample lower intermolecular distances. </div><div><br></div><div>I would apply an half-harmonic potential centered around 6 A and growing for larger distances. Unfortunately, I have found only harmonic potentials for constraining collective variables ( https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/CONSTRAINT/COLLECTIVE/RESTRAINT.html)</div><div>, which would prevent sampling of distances lower than 6 A.</div><div><br></div><div>I would be very grateful if you could suggest me any solutions for my problem.</div><div>Thank you in advance.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Emma Rossi</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/521a4ccf-368c-4afa-bc4f-028e581cc6b4n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/521a4ccf-368c-4afa-bc4f-028e581cc6b4n%40googlegroups.com</a>.<br />