<div>Hello all,</div><div>i have set up a QM/MM system with cp2k (i have
 a big system with a 54 amino acids protein, 4 zinc atoms and H2O as 
solvent) i selected specific residues of the protein and the zinc atoms 
for QM treatment, the rest of the system should be treated in MM using 
CHARMM36.</div><div><br></div><div>When i launch the calculation i get this error (attached).</div><div>Do you have an idea what could cause this ?</div><div><br></div><div>Also i read on the cp2k tutorial about 
chorismate mutase written by 
Dries Van Rompaey</div><div>that we can generate a topology with amber tools with  
<span><span>antechamber and 
 parmchk.</span></span></div><div><span><span>Is there another way of generating the topology  then using amber tools ?</span></span></div><div><span><span><br></span></span></div><div>Thank you for your time,</div><div>kind regards.</div><div><br></div><div>Mario</div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/10dca240-066f-4baa-a111-23f38e96717cn%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/10dca240-066f-4baa-a111-23f38e96717cn%40googlegroups.com</a>.<br />