<div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>Any suggestions? How I can plot the IR spectra from above outputs. </div><div><br></div><div>Thanks</div><div>Sumit</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, Nov 6, 2021 at 10:24 AM sumit agrawal <<a href="mailto:sumitagrawal145@gmail.com">sumitagrawal145@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hii everyone,<br><div><br></div><div>I have done the MD in cp2k to calculate vibrational spectra of methanol. My calculation is done for MD, and I am using TRAVIS to analyse the trajectory. The trajectory file is " <a href="http://methanol_wannier.xyz/" target="_blank">methanol_wannier.xyz</a>" and after using TRAVIS I obtain 4 files which are given below. Now in #1#ir_spectrum_CH4O and #1#ir_spectrum_global there are entries only in X column other having 0 values and ir_spectrum_global, ir_spectrum_CH4O have both the values but Y having very large values (is it noise or something problem with my trajectory ?).</div><div><br></div><div>Now my question is which files I have to consider for the IR plot and how to plot IR spectra. Because in one case Y having 0 values and in the other case Y having very large values.</div><div><br></div><div><br></div><div>I also attached the input file for this MD run.</div><div><br></div><div>Please help me in this regard.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>sumit</div></div>
</blockquote></div>

<p></p>

-- <br />
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br />
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsubscribe@googlegroups.com">cp2k+unsubscribe@googlegroups.com</a>.<br />
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CALSDoYY99S1kYj%2Bm-EcbSr%3DuOFuC6M2E8szx2N3D2RsopZs3%2Bg%40mail.gmail.com?utm_medium=email&utm_source=footer">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/CALSDoYY99S1kYj%2Bm-EcbSr%3DuOFuC6M2E8szx2N3D2RsopZs3%2Bg%40mail.gmail.com</a>.<br />