Dear Hongxia<div><br></div><div>Yes it is possible to constrain/restrain the position of a molecule. </div><div>There are several ways to do it, either with restraints, or using external potentials, or doing metadynamics adding specific walls.</div><div>Yes in metadynamics such a restriction would affect the free energy, how and how much depends on the processes you are looking at. </div><div>Examples and test inputs can be found on cp2k.org and among the regtests in the repository. </div><div>e.g.,</div><div>https://www.cp2k.org/exercises:2015_cecam_tutorial:mtd1</div><div>cp2k/tests/Fist/regtest-15/metadyn4.inp</div><div>cp2k/tests/Fist/regtest-10/c60_pl_pl_angl1_restr.inp</div><div><br>Regards</div><div>Marcella</div><div><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Monday, July 19, 2021 at 3:39:28 AM UTC+2 hon...@gmail.com wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Dear cp2k users,<div><br></div><div>I am trying to simulate a slab system, and would like to constrain one molecule at the interfacial region. Would that be possible to constrain the z position of a molecule in some range and do metadynamics? By doing that, would the free energy be changed because of the constaint? If that is possible, Could some one provide me the input doing that? </div><div><br></div><div>Thanks in advance!</div><div><br></div><div>Sincerely</div><div>Hongxia</div></blockquote></div>