<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"> <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"> <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"> <style></style> </head> <body lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"> <div class="WordSection1"> <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hi, I am afraid, you will have to invest much more resources than 16 cores for a vibrational analysis of such a system.<o:p></o:p></span></p> <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p> <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">M.<o:p></o:p></span></p> <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p> <div style="border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0cm 0cm 0cm 4.0pt"> <div> <div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm"> <p class="MsoNormal"><b><span lang="DE" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">Von:</span></b><span lang="DE" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> cp...@googlegroups.com <...@googlegroups.com> <b>Im Auftrag von </b>Ruel<br> <b>Gesendet:</b> Freitag, 18. Juni 2021 18:28<br> <b>An:</b> cp2k <...@googlegroups.com><br> <b>Betreff:</b> [CP2K:15597] How to Speed Up Vibrational Analysis with SCCS<o:p></o:p></span></p> </div> </div> <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p> <p class="MsoNormal">Hi everyone,<o:p></o:p></p> <div> <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal">I would like to obtain the thermodynamic properties of a nanocrystal in water using CP2K and SCCS implicit solvation model. However, the calculation is taking too much time (6 days, 16 cores). <o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal">Any suggestions will be greatly appreciated. Here's my input file.<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p> </div> <div> <div> <p class="MsoNormal"> &GLOBAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PRINT_LEVEL HIGH<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PROJECT_NAME nacl<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> RUN_TYPE VIBRATIONAL_ANALYSIS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END GLOBAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &VIBRATIONAL_ANALYSIS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> FULLY_PERIODIC F<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> THERMOCHEMISTRY T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> NPROC_REP 16<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END VIBRATIONAL_ANALYSIS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &FORCE_EVAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> METHOD QS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #STRESS_TENSOR NUMERICAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &DFT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET_FILE_NAME ./BASIS_MOLOPT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL_FILE_NAME ./GTH_POTENTIALS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> WFN_RESTART_FILE_NAME nacl-RESTART.wfn<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> UKS T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> ROKS F<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #MULTIPLICITY 1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> CHARGE 0<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &SCF<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> MAX_SCF 1000<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> EPS_SCF 3.0000000000000001E-07<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> SCF_GUESS RESTART<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &OT T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> MINIMIZER DIIS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #PRECONDITIONER FULL_SINGLE_INVERSE<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> ALGORITHM STRICT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #MINIMIZER CG<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #LINESEARCH 2PNT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PRECONDITIONER FULL_ALL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #ENERGY_GAP 1.0000000000000000E-03<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END OT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &DIAGONALIZATION F<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> ALGORITHM STANDARD<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END DIAGONALIZATION<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END SCF<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &QS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> METHOD GPW<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> EPS_DEFAULT 3.0000000000000000E-7<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> EXTRAPOLATION USE_GUESS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END QS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &MGRID<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> NGRIDS 4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> CUTOFF 5.0000000000000000E+02<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> REL_CUTOFF 8.0000000000000000E+01<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END MGRID<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &XC<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #DENSITY_CUTOFF 1.0000000000000000E-10<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #GRADIENT_CUTOFF 1.0000000000000000E-10<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #TAU_CUTOFF 1.0000000000000000E-10<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &XC_FUNCTIONAL <o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &PBE<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PARAMETRIZATION PBESOL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END PBE<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END XC_FUNCTIONAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &VDW_POTENTIAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL_TYPE PAIR_POTENTIAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &PAIR_POTENTIAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> R_CUTOFF 1.2000000000000000E+01<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> TYPE DFTD3<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PARAMETER_FILE_NAME ./dftd3.dat<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> REFERENCE_FUNCTIONAL PBE<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> CALCULATE_C9_TERM T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> LONG_RANGE_CORRECTION T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> VERBOSE_OUTPUT T<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END PAIR_POTENTIAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END VDW_POTENTIAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END XC<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #&KPOINTSep<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # SCHEME MONKHORST-PACK 2 2 2<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # SYMMETRY OFF<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # WAVEFUNCTIONS REAL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # FULL_GRID .TRUE.<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # PARALLEL_GROUP_SIZE 0<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #&END KPOINTS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &SCCS on<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> DIELECTRIC_CONSTANT 78.4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> EPS_SCF 1.0e-3<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> EPS_SCCS 3.0E-6<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #GAMMA 29.29<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #DERIVATIVE_METHOD CD5<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> MAX_ITER 150<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> METHOD ANDREUSSI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &ANDREUSSI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # RHO_MAX 1.0e-4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> # RHO_MIN 1.0e-5<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END ANDREUSSI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"># #METHOD FATTEBERT-GYGI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"># # &FATTEBERT-GYGI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"># # BETA 1.3<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"># # RHO_ZERO 7.8E-4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"># #&END FATTEBERT-GYGI<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #MIXING 0.6<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END SCCS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &PRINT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &SCCS on<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &EACH<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> QS_SCF 1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END EACH<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END SCCS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &MULLIKEN SILENT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> FILENAME mulliken.out<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END MULLIKEN<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END PRINT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END DFT<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &SUBSYS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &CELL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> ABC 50 50 50 <o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #PERIODIC XYZ<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> PERIODIC NONE<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #MULTIPLE_UNIT_CELL 1 2 1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END CELL<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &TOPOLOGY<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> COORD_FILE_NAME coord.xyz<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> COORDINATE XYZ<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> CONN_FILE_FORMAT OFF<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> #MULTIPLE_UNIT_CELL 1 2 1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &CENTER_COORDINATES<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END TOPOLOGY<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND H<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q1<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND N<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH-q5<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q5<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND O<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q6<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q6<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND C<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q4<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND Zr<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q12<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PADE-q12 <o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND Cl<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q7<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q7<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &KIND Na<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> POTENTIAL GTH-PBE-q9<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END KIND<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END SUBSYS<o:p></o:p></p> </div> <div> <p class="MsoNormal"> &END FORCE_EVAL<o:p></o:p></p> </div> </div> <p class="MsoNormal">-- <br> You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br> To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k+unsu...@googlegroups.com">cp2k+unsu...@googlegroups.com</a>.<br> To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9429b260-f9c4-428c-a4f7-96e2165f8911n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer"> https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/9429b260-f9c4-428c-a4f7-96e2165f8911n%40googlegroups.com</a>.<o:p></o:p></p> </div> </div> </body> </html>