hi <div>Is this website(<a href="https://drive.google.com/open?id=0B9kQhpI16-FudWhuUUxNT1AwQlE">https://drive.google.com/open?id=0B9kQhpI16-FudWhuUUxNT1AwQlE</a>) valid?  I can't open.<br><div><br><br></div></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">在2017年2月23日星期四 UTC+8 下午4:15:42<Ivan Gladich> 写道:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I am trying to model some surfactants on a liquid water slab using AdBF-QMMM.</div><div>The system was pre-euilibrated using classical MD and I remove the CoM movement using</div><div><p style="font-size:11px;font-family:Menlo"><br></p><p style="font-size:11px;font-family:Menlo">COMVEL_TOL  1.0E-10</p><p style="font-size:11px;font-family:Menlo"><br></p></div><div>By the way, even after removing the CoM, the system experience some CoM movement. </div><div>The trajectory looks like "shaking". </div><div>I placed the trajectory and the X,Y,Z-position of my QM atom (file  Br_pos.dat) together with my input at </div><div><br></div><div><a href="https://drive.google.com/open?id=0B9kQhpI16-FudWhuUUxNT1AwQlE" target="_blank" rel="nofollow" data-saferedirecturl="https://www.google.com/url?hl=zh-CN&q=https://drive.google.com/open?id%3D0B9kQhpI16-FudWhuUUxNT1AwQlE&source=gmail&ust=1619014968038000&usg=AFQjCNFq_FG2pZckKmqXkZJMq96Ix5z0dw">https://drive.google.com/open?id=0B9kQhpI16-FudWhuUUxNT1AwQlE</a><br></div><div><br></div><div>Is this something excepted in QMMM due to the way in which forces are computed?</div><div><br></div><div>I remember, but I not sure, that the code should try place the QM dynamical region in order to avoid crossing with the PBC box.</div><div>But again, not sure of that...</div><div><br></div><div>Thank you for any possible help</div><div><br></div><div>Ivan</div></div></blockquote></div>