<br><div>Hello all,</div><div>I am trying to set up a QM/MM simulation. However, my job inmediately crashes with a routine calling stack 2 in qmmm_env_create.</div><div>I cant find the mistake in the input file. Please any help?</div><div>Thank you<br></div><div><br>&GLOBAL<br>  PROJECT QMMM<br>  PRINT_LEVEL LOW<br>  RUN_TYPE MD<br>&END GLOBAL<br> <br>&FORCE_EVAL<br>  METHOD QMMM<br>  STRESS_TENSOR ANALYTICAL<br>  &DFT<br>    CHARGE 0<br>    &QS<br>      METHOD PM3<br>      &SE<br>         &COULOMB<br>           CUTOFF [angstrom] 10.0<br>         &END<br>         &EXCHANGE<br>           CUTOFF [angstrom] 10.0<br>         &END<br>      &END<br>    &END QS<br>    &SCF<br>      MAX_SCF 2000<br>      EPS_SCF 1.0E-6<br>      SCF_GUESS ATOMIC<br>      &OT<br>        MINIMIZER DIIS<br>        PRECONDITIONER FULL_SINGLE_INVERSE<br>      &END<br>      &OUTER_SCF<br>        EPS_SCF 1.0E-6<br>        MAX_SCF 100<br>      &END<br>    &END SCF  <br>  &END DFT<br>  &MM<br>    &FORCEFIELD<br>      PARMTYPE AMBER<br>      PARM_FILE_NAME system_LJ_mod.prmtop<br>      &SPLINE<br>        EMAX_SPLINE 1.0E8<br>        RCUT_NB [angstrom] 10<br>      &END SPLINE<br>    &END FORCEFIELD<br>    &POISSON<br>      &EWALD<br>        EWALD_TYPE SPME<br>        ALPHA .40<br>        GMAX 80<br>      &END EWALD<br>    &END POISSON<br>  &END MM<br>  &SUBSYS<br>    &CELL<br>    !Set box dimensions here<br>      ABC [angstrom] 64.5852705  57.3788370  65.5238534 <br>      ALPHA_BETA_GAMMA 90 90 90<br>    &END CELL<br>    &TOPOLOGY<br>      CONN_FILE_FORMAT AMBER<br>      CONN_FILE_NAME system_LJ_mod.prmtop<br>      COORD_FILE_FORMAT CRD<br>      COORD_FILE_NAME system.equil0.crd<br>    &END TOPOLOGY<br>    &KIND CL-<br>     ELEMENT Cl<br>    &END KIND<br>    &KIND O3<br>     ELEMENT O<br>    &END KIND<br>    &KIND O1<br>     ELEMENT O<br>    &END KIND<br>    &KIND H2<br>     ELEMENT H<br>    &END KIND<br>    &KIND ZN2+<br>     ELEMENT ZN<br>   &END KIND<br>    &KIND H4<br>     ELEMENT H<br>    &END KIND<br>  &END SUBSYS<br>    &QMMM<br>    ECOUPL COULOMB<br>    &CELL<br>      ABC 20 20 20<br>      ALPHA_BETA_GAMMA 90 90 90<br>    &END CELL<br><br>    &QM_KIND N<br>      MM_INDEX 1306 1309<br>    &END QM_KIND<br><br>    &QM_KIND O<br>      MM_INDEX 3009 3011<br>    &END QM_KIND<br><br>    &QM_KIND C<br>      MM_INDEX 1261 2224 2270 1307 1311 1305<br>    &END QM_KIND<br><br>    &QM_KIND H<br>      MM_INDEX 1262 1263 2225 2226 2271 2272 3010 3012<br>    &END QM_KIND<br><br>    &QM_KIND ZN<br>      MM_INDEX 3008<br>    &END QM_KIND<br><br>    &QM_KIND S<br>      MM_INDEX 1264 2227 2273<br>    &END QM_KIND<br><br>    &LINK<br>      MM_INDEX 2222<br>      QM_INDEX 2224 <br>      LINK_TYPE IMOMM<br>    &END LINK<br>   &LINK<br>      MM_INDEX 1259<br>      QM_INDEX 1261 <br>      LINK_TYPE IMOMM<br>    &END LINK<br>   &LINK<br>      MM_INDEX 2268<br>      QM_INDEX 2270<br>      LINK_TYPE IMOMM<br>    &END LINK<br>   &LINK<br>      MM_INDEX 1305<br>      QM_INDEX 1302<br>      LINK_TYPE IMOMM<br>    &END LINK<br>  &END QMMM<br><br>&END FORCE_EVAL<br> <br>&MOTION<br>  &MD<br>  ENSEMBLE NPT_I<br>  TIMESTEP [fs] 0.5<br>  STEPS    200<br>  TEMPERATURE 300<br>  &BAROSTAT<br>    TIMECON [fs] 100<br>    PRESSURE [bar] 1.0<br>  &END BAROSTAT<br>  &THERMOSTAT<br>    REGION GLOBAL<br>    TYPE CSVR<br>    &CSVR<br>      TIMECON [fs] 10.<br>    &END CSVR<br>  &END THERMOSTAT<br>  &END MD<br>  &PRINT<br>    &RESTART                                    ! This section controls the printing of restart files<br>      &EACH                                     ! A restart file will be printed every 10000 md steps<br>        MD 25000<br>      &END<br>    &END<br>    &TRAJECTORY                                 ! Thes section Controls the output of the trajectory<br>      FORMAT DCD                                ! Format of the output trajectory is DCD<br>      &EACH                                     ! New trajectory frame will be printed each 100 md steps<br>        MD 4<br>      &END<br>    &END<br>    &RESTART_HISTORY                            ! This section controls dumping of unique restart files during the run keeping all of them.Most useful if recovery is needed at a later point.<br>      &EACH                                     ! A new restart file will be printed every 10000 md steps<br>        MD 5000<br>      &END<br>    &END<br>    &CELL<br>      &EACH<br>        MD 100<br>      &END<br>    &END<br>  &END PRINT<br>&END MOTION</div>