Dear CP2K users,<div><br></div><div>Recently I am learning Metadynamics and setting collective variables in CP2K. Following the exercise (https://www.cp2k.org/exercises:2015_cecam_tutorial:mtd1), I also wanted to set the distance between plane and point as a collective variable in my simulation. The setting content is as follows:</div><div><br></div><div><div>    &COLVAR</div><div>       &DISTANCE_POINT_PLANE</div><div>         &POINT</div><div>           TYPE GEO_CENTER</div><div>           ATOMS 52</div><div>         &END</div><div>         &POINT</div><div>           TYPE GEO_CENTER</div><div>           ATOMS 56</div><div>         &END</div><div>         &POINT</div><div>           TYPE GEO_CENTER</div><div>           ATOMS 60</div><div>         &END</div><div>         &POINT</div><div>           TYPE GEO_CENTER</div><div>           ATOMS 308</div><div>         &END</div><div>          ATOMS_PLANE 1 2 3</div><div>          ATOM_POINT 4</div><div>          PBC .TRUE.</div><div>       &END DISTANCE_POINT_PLANE</div><div>    &END COLVAR</div></div><div><br></div><div>The first three points refer to the defined plane (the index corresponds to the atomic index in the xyz file). The last point is the point in this CV. However, once the simulation is running, from the colvar.metadynlog file, the distance between the plane and the point is a negative value (around -19 Angstrom). The absolute distance between the point and the plane is supposed to be 10 Angstrom. Part of the metadynlog file is:</div><div><br></div><div><div>      0.00000000    -19.42924      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      0.50000000    -19.43199      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      1.00000000    -19.43482      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      1.50000000    -19.43771      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      2.00000000    -19.44067      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      2.50000000    -19.44370      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      3.00000000    -19.44680      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      3.50000000    -19.44997      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div><div>      4.00000000    -19.45320      0.00000      0.00000      0.00000      0.00000</div></div><div><br></div><div>I have attached the the xyz file in this email. Could anyone please help me on this problem?</div><div><br></div><div>I am looking forward to your reply.</div><div><br></div><div>Best Regards,</div><div>Bingxin Li</div>