Dear Tlyer,<div><br></div><div>One way to achieve this is to prepare the system with some MD run at a desired temperature.</div><div>Then you restart the MD from the generated .restart file, where you have ad hoc modified the velocities of the atoms that you want to accelerate.</div><div>Obviously in the EXT_RESTART section the restarting of velocities has to be activated. </div><div><br></div><div>Kind regards</div><div>Marcella</div><div><br></div><div><br><br></div><div class="gmail_quote"><div dir="auto" class="gmail_attr">On Sunday, October 18, 2020 at 2:17:09 PM UTC+2 ts...@gmail.com wrote:<br/></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0 0 0 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Dear users：<div>    </div><div>Recently,i read a paper refers to a  molecule with a setted velocity  colliding with a air-water interface.  So i am confused  with the velocity setting . If i want give a velocity for my one molecule ,which session should i place the keyword in ? And what else important settings i should focus . </div><div><br></div><div>thanks！</div><div>Tlyer</div></blockquote></div>