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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hi Nam<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">From the provided information, I can only guess. Possibly, the two thermal regions are encompassing already the whole system, i.e. all 187 atoms, and thus no
atom is left for the “default” region which would explain the zero temperature.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Matthias<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> cp...@googlegroups.com <...@googlegroups.com>
<b>On Behalf Of </b>Nam Tran<br>
<b>Sent:</b> Mittwoch, 14. Oktober 2020 14:30<br>
<b>To:</b> cp2k <...@googlegroups.com><br>
<b>Subject:</b> [CP2K:14047] Temperature output of Langevin molecular dynamics<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Hi,<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">I am trying to do Langevin MD simulation with two different ensemble (NVT/NVE). However, the output shows three columns of temperature. Can someone explain to me the meaning of those columns? <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"># Temperature per Region<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"># Step Nr. Time[fs] Temp.[K] ....<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> 5001 5001.000 0.000000 214.103289 180.910808<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> 5002 5002.000 0.000000 212.361238 188.302424<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> .................<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Here is my MD input section:<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> <o:p></o:p></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &MD<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> ENSEMBLE LANGEVIN<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> TIMESTEP [fs] 1<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> STEPS 2000 <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> TEMPERATURE [K] 300<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> TEMP_KIND<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &LANGEVIN<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> GAMMA 0.001<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> NOISY_GAMMA 0<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END LANGEVIN<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &THERMAL_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> DO_LANGEVIN_DEFAULT F<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &DEFINE_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> TEMPERATURE 300<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> DO_LANGEVIN T<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> LIST 1..146<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> NOISY_GAMMA_REGION 1.0E-4<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END DEFINE_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &DEFINE_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> DO_LANGEVIN F<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> LIST 147..187<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END DEFINE_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &PRINT <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &TEMPERATURE<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &LANGEVIN_REGIONS<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END LANGEVIN_REGIONS<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END PRINT<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END THERMAL_REGION<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"> &END MD<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Best Regards<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Nam<o:p></o:p></p>
</div>
<p class="MsoNormal">-- <br>
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