Hi,<div><br></div><div>I need to run a simulation of a molecule adsorb on a slab and I would like to do two things. </div><div>1) thermostat (CSVR) the slab</div><div>2) assign a specific velocity to the molecule.</div><div>I found that I can do that by using THERMOSTAT/DEFINE_REGION. However, the keyword MD/THERMOSTAT/REGION confuses me. I did the test using GLOBAL and DEFINED options. By using GLOBAL the output says nothing and I do not know whether the thermostat was applied to the surface or the whole system. By using DEFINED the output shows</div><div><br></div><div><div> WARNING| No thermostats defined for the following atoms:</div><div> WARNING|  ......................</div><div> WARNING| They will be included in a further unique thermostat!</div></div><div><br></div><div>So I have three questions:</div><div>1) should I stick with the DEFINED option? </div><div>2) how do I know the thermostat is applied on the slab?<br></div><div>3) what is the meaning of "further unique thermostat" in the warning?</div><div><br></div><div>Regards</div><div>Nam</div>