<div dir="ltr">Hi 冬，<div><br></div><div>1). Talk to your superviser if you are a student~</div><div><br></div><div>2). The reason that the organic unexpectedly decomposed is probabaly that it wants to decompose at current conditions (i.e. NVT, 300K, etc).</div><div><br></div><div>3). You can prevent it from happening by constraining or fixing bond length in MD calculations, if you konw what you are doing. </div><div><br></div><div>Good luck!</div><div>Haibei</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">冬tlyer <<a href="mailto:tsd19...@gmail.com">tsd19...@gmail.com</a>> 于2020年10月6日周二 上午9:16写道：<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Dear users,<div><br></div><div>I let three moleclues(H2SO4,organic,H2O)  running  AIMD in my computer. But after running the Aperiodic molecular system  for a while. I took out the track-file to display in VMD. And i find  the  the organic  unexpectedly decomposed(as show below).</div><div><br></div><div> So the question is how to change my input file or add some other keyword for solve this question.  In other words, what caused my system to decompose.The input-file and the molecules inages as attach is present below.</div><div><br></div><div>thanks!</div><div>tlyer</div><div><img alt="first.jpg" width="198px" height="189px" src="cid:06e0ba28-6574-4273-a880-0608e4b35980"><img alt="final.jpg" width="198px" height="189px" src="cid:85e5549a-ea1f-4948-8889-af55da5541a3"></div>

<p></p>

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/7b089edd-05de-43dc-aa21-c3321f486255n%40googlegroups.com?utm_medium=email&utm_source=footer" target="_blank">https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/7b089edd-05de-43dc-aa21-c3321f486255n%40googlegroups.com</a>.<br>
</blockquote></div>