<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>Convert the coordinates in your input file to XYZ. You need only a single snapshot. Then load the XYZ into VMD and select to load additional data into the molecule to append the DCD. The XYZ file is used just to add the atom names. You can also use one of the snapshots from your old XYZ trajectory to do this.</div><div><br></div><div>-T</div><div><br><br>On Saturday, December 14, 2019 at 3:04:56 AM UTC-5, lizzy bai wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Dear Prof. Travis<div><br></div><div>Thank you very much for you information.</div><div>I have formated the trajectory as DCD. Then the outfile only has DCD file, no xyz file. The following keywords I used as below:</div><div> &TRAJECTORY</div><div>       FORMAT DCD<br>     &EACH<br>       MD 1<br>     &END EACH<br>   &END TRAJECTORY<br></div><div><br></div><div>Best regards</div><div><br></div><div>Liyi</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Travis <<a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="3W9k5OYYAQAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">po...@gmail.com</a>> 于2019年12月13日周五 下午10:45写道：<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
You load an XYZ first. Then load DCD as additional data. DCD doesn't contain atom names.<br>
<br>
-T<br>
<br>
-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="3W9k5OYYAQAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.<wbr>com</a>.<br>
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/99e88dd0-a25f-4b2c-8f2b-92afd080e603%40googlegroups.com" rel="nofollow" target="_blank" onmousedown="this.href='https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/99e88dd0-a25f-4b2c-8f2b-92afd080e603%40googlegroups.com';return true;" onclick="this.href='https://groups.google.com/d/msgid/cp2k/99e88dd0-a25f-4b2c-8f2b-92afd080e603%40googlegroups.com';return true;">https://groups.google.com/d/<wbr>msgid/cp2k/99e88dd0-a25f-4b2c-<wbr>8f2b-92afd080e603%<wbr>40googlegroups.com</a>.<br>
</blockquote></div>
</blockquote></div></div>