<div dir="ltr">The unit is Hartree, you need to times it 628 if you want to convert it to unit kcal/mol.<br><br>在 2017年3月28日星期二 UTC+8上午4:45:15，Anthony Debellis写道：<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div>Dear Sirs,</div><div>I am using the graph program to build the FES.  I have "colvar" and "parvar" files generated with CPMD (attached) which I use as a test case for the graph program.  I know from another program (Vreco) that the minimum of my FES is ~ 94 kJ/mol.  When I run "graph" using the following command:</div><div><br></div><div>(to create a 1-d slice along CV 1, projected FES)</div><div><br></div><div>./graph.popt -cpmd -stride 50 -ndw 1 -ndim 2</div><div><br></div><div>and plot the result, the plot looks qualitatively correct but the magnitude of the minimum seems incorrect.</div><div><br></div><div>What am I missing?  What are the energy units in fes.dat?  At which value of CV 2 is the projected FES cut? (I assumed the value of CV2 at the minimum of the 2-d FES)</div><div><br></div><div>Please help!</div><div><br></div><div>Anthony</div></div></blockquote></div>