<div dir="ltr">I think the RDF only depends on the position of particles. So you can use any codes you can download to calculate RDF.<div>Here, the position of particles should be <b>Unwrapped</b>, which means the position should not be wrapped back into the periodic box.  </div><div>As for the density for normalization of RDF, I think you can use optimized density.</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Justin</div><div><div><br><br>在 2019年10月23日星期三 UTC+8下午5:05:15，Ant写道：<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div>I am re-posting a question I already asked in the hope that someone who can help will see it.  <br></div><div><br></div><div>I already have NPT simulation results and would like to plot RDFs.  I usually use VMD, but the RDF GUI only allows a single set of cell parameters.  I need to be able to enter a distinct set of cell parameters at each time step.  <br></div><div><br></div><div>Does anyone know whether it is possible to do this in VMD or if there is another piece of software that can do it?  I have not found anything in my own searches.  Thank you.<br></div></div></blockquote></div></div></div>