<div dir="ltr">if we don't consider COMVEL_TOL the results of calculations become wrong? <br><br>On Tuesday, November 10, 2015 at 1:56:03 AM UTC+8, l...@lbl.gov wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I have been studying water systems of different sizes for a while now (I have attached here an example input file ). In these simulations I consistently observe the center of mass of the system drifting (i.e. the whole system is moving).</div><div><br></div><div>I'm running BOMD in the NVT ensemble using a Nose-Hoover massive thermostat chain. My best guess to explain the drift of the system is that the random velocities imposed by the thermostat (maybe during initialization) are not canceling out exactly. Is there a way of constraining the momentum of the system's center of mass to get rid of this issue?</div><div><br></div><div>I am also observing a sort of estrange long term behavior in the temperature where the temperature vs. time curve exhibits a long-wave fluctuation (I have attached a plot here, x-axis is number of steps and y-axis is temperature in K). I'm afraid this could be an artifact of the thermostat.<br></div><div><br></div><div>If this is not an artifact of the thermostat I am not quite sure what could be causing it, any other ideas?</div><div><br></div><div>Thanks for your help!</div><div>Luis</div></div></blockquote></div>