<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>REFTRAJ allows you to read a trajectory back into CP2K. You can read the coordinates back in, read a second file with cell parameters (https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/MD/REFTRAJ.html), and then dump a DCD file (https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/PRINT/TRAJECTORY.html). <br></div><div><br></div><div>Alternatively, you can compute a RDF with TRAVIS (http://www.travis-analyzer.de/). This will read a trajectory in XYZ format and you can replace the comment line with the lattice parameters in Angstroms and degrees (a b c alpha beta gamma). You'd have to swap these frame-by-frame using a Unix-y solution like sed. I think the program can read the cell parameters from an external file as well.<br></div><div><br></div><div>-T<br></div><div><br></div><br>On Monday, August 26, 2019 at 1:26:50 PM UTC-3, Ant wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">I'd like to add that Travis has provided very useful advice for the future, but it would be great to know how I can deal with simulations that I already have.  Does anyone know how to plot RDFs that use the cell volume data from the *.cell file (i.e., update cell volume at each timestep)?  Thank you.</div></blockquote></div>