<div dir="ltr">Dear all,<div>hello everyone, I am fresh to use cp2k, my version is 2.5.0</div><div>here some problems happened to me when i make some input file to calculate MD.</div><div>1. in the input file input1.inp, when i set the coordinates to another file, the program cannot work and the error is given as:</div><div><div> </div><div><br></div><div>********************************************</div><div>  4  *** ERROR in open_file (MODULE cp_files) ***</div><div>  5  ********************************************</div><div>  6 </div><div>  7  *** The specified OLD file <a1.xyz   #  Adapt this ***</div><div>  8  *** name above> cannot be opened. It does not exist.                    ***</div><div>  9 </div><div> 10  *** Program stopped at line number 375 of MODULE cp_files ***</div><div> 11 </div><div> 12  ===== Routine Calling Stack =====</div><div> 13 </div><div> 14             2 handle_ext_restart</div><div> 15             1 check_cp2k_input</div><div> 16  CP2K| Abnormal program termination, stopped by process number 0</div><div> 17 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0</div><div> 18 yhrun: error: cn374: task 0: Exited with exit code 1</div><div> 19 yhrun: First task exited 60s ago</div><div> 20 yhrun: tasks 1-71: running</div><div> 21 yhrun: task 0: exited abnormally</div><div> 22 yhrun: Terminating job step 14165020.0</div><div> 23 slurmd[cn374]: *** STEP 14165020.0 KILLED AT 2019-06-28T10:29:40 WITH SIGNAL 9 ***</div><div> 24 yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.</div><div> 25 slurmd[cn374]: *** STEP 14165020.0 KILLED AT 2019-06-28T10:29:40 WITH SIGNAL 9 ***</div><div> 26 yhrun: error: cn374: tasks 1-11: Killed</div><div>~   </div></div><div>I put input1.inp and a1.xyz at the same folder.</div><div><br></div><div><br></div><div>then i just remove "@INCLUDE a1.txt              #  Adapt this", and copy the coordinates from a1.xyz to input1.inp, it works.</div><div>BUT WHY THIS ERROR HAPPENED? </div><div>could anyone help me and tell me how to do, please.</div><div><br></div><div>2. then i change the thermostat to run another md based on 1, BUT similar problem happends:</div><div><div> </div><div>********************************************</div><div>  4  *** ERROR in open_file (MODULE cp_files) ***</div><div>  5  ********************************************</div><div>  6 </div><div>  7  *** The specified OLD file <PropOx-1.restart  #  Needs to match project ***</div><div>  8  *** name above> cannot be opened. It does not exist.                    ***</div><div>  9 </div><div> 10  *** Program stopped at line number 375 of MODULE cp_files ***</div><div> 11 </div><div> 12  ===== Routine Calling Stack =====</div><div> 13 </div><div> 14             2 handle_ext_restart</div><div> 15             1 check_cp2k_input</div><div> 16  CP2K| Abnormal program termination, stopped by process number 0</div><div> 17 application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0</div><div> 18 yhrun: error: cn374: task 0: Exited with exit code 1</div><div> 19 yhrun: First task exited 60s ago</div><div> 20 yhrun: tasks 1-71: running</div><div> 21 yhrun: task 0: exited abnormally</div><div> 22 yhrun: Terminating job step 14165020.0</div><div> 23 slurmd[cn374]: *** STEP 14165020.0 KILLED AT 2019-06-28T10:29:40 WITH SIGNAL 9 ***</div><div> 24 yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.</div><div> 25 slurmd[cn374]: *** STEP 14165020.0 KILLED AT 2019-06-28T10:29:40 WITH SIGNAL 9 ***</div><div> 26 yhrun: error: cn374: tasks 1-11: Killed</div><div>~                                                       </div></div><div><br></div><div>please refer to input2.inp and PropOx-1.restart</div><div>here i delete "@INCLUDE a1.txt              #  Adapt this" and copy the last frame of MD1</div><div><br></div><div>I try my best to search my problem but it still there and I hope anyone know the reason can tell me why and how to do.</div><div>thank you very much!!!</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div>