Dear all,<br><br><div>I'm trying to run a metadynamic using as a 
collective variable (CV) the coordination number between two atoms. I 
have two main questions about this:</div><div><br></div>1.- How can I use more than one atom in the coordination number formula?<br><div>2.- How can I write a mathematical expression to use as a CV? For example something like:<img src="cid:autoGeneratedInlineImage1" alt=""> where <img src="cid:autoGeneratedInlineImage2" alt=""> is the length of the i-th bond. <br></div><div><br></div><div>Regards<br>Nicolás Rozas Castro<br></div><div><br></div><div><br></div>