<div dir="ltr">Dear Vladimir,<div><br></div><div>Thank you for the reply. Actually I'm using a GLE thermostat to pump energy into one specific mode while having the other modes at base temperature. In order to make sure that the energy is correctly pumped to that mode, I need to monitor the vibrational temperature of the atoms that are coupled to the mode that I want to excite. Someone told me that might be possible using TAMKIN, but considering that I'm quite new in this field I have no clue how to do that. </div><div>The only thing that I want to do is to achieve vibrational temperature of each atom during a MD run.</div><div><br></div><div>Kind regards,</div><div><br></div><div>Amin<br><br>On Thursday, March 7, 2019 at 12:12:41 PM UTC+1, Vladimir Rybkin wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Dear Amin,<div><br></div><div>I am not sure whether I understood the question correctly. You may want to try to modify the thermostat region:</div><div><a href="https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/MD/THERMOSTAT.html" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Fmanual.cp2k.org%2Ftrunk%2FCP2K_INPUT%2FMOTION%2FMD%2FTHERMOSTAT.html\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNEFDQhnuAne4UAczFPDgWJwjodOVw';return true;" onclick="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Fmanual.cp2k.org%2Ftrunk%2FCP2K_INPUT%2FMOTION%2FMD%2FTHERMOSTAT.html\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNEFDQhnuAne4UAczFPDgWJwjodOVw';return true;">https://manual.cp2k.org/trunk/<wbr>CP2K_INPUT/MOTION/MD/<wbr>THERMOSTAT.html</a><br></div><div><br></div><div>Yours,</div><div><br></div><div>Vladimir</div><div><br><br>среда, 6 марта 2019 г., 18:53:35 UTC+1 пользователь Amin написал:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I was wondering how I can achieve vibrational temperature of an atom (or a couple of atoms) in a molecule during a MD simulation. Is that possible by using CP2K?</div><div><br></div><div>Thanks in advance.</div><div><br></div></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div>