<div dir="ltr"><div><br></div>Before getting involved in AIMD simulations, probably you need to go back to books to learn about condensed matter electronic structure theory. <div>Can your reproduce the electronic properties of this MOF with your DFT settings?</div><div>Anyway, to simulate an isolated fragment you need a CELL that is about twice as large as the system and you have to choose a proper Poisson solver. </div><div>Regards</div><div>Marcella</div><div><br><br>On Thursday, February 21, 2019 at 2:52:47 AM UTC+1, M. Memol wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="auto">Thank you so much for your response. Actually I am an Abinitio user and I am very new in AIMD. And the part MD is a kind of black box for me. But before doing AIMD, and along with studying precious book of prof. Hutter, i decided to get familliar to the program package with the aid of the excerices. Yes this an isolated part of a crystal. A first building block of a MOF. Before your answer, I did some modification in the input. For example i turned on the periodic option and as a result, the menrioned fluctuation disappeared and scf coverged. But what if I do not want to use periodic system and just optimize this isolated part?</div><div><br><div class="gmail_quote">On Feb 20, 2019 6:19 PM, "Marcella Iannuzzi" <<a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="eXogwZPlBQAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">marc...@gmail.com</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Either the structure or the DFT setting must have serious problems, since the SCF is never converging. <div>For example in SUBSYS you use "periodic none" with a box of 15 Å, but your system seems to be larger than that.</div><div>On the other hand, POISSON is still using PBC.  What do you want to model, an isolated subsystem of a crystal?</div><div><div>With such a wrong electronic structure you cannot expect any meaningful evaluation of the forces.</div><div>Before starting the GEO_OPT you need to be able to get a reasonable electronic structure of the initial state.</div><div><br></div><div>Regards</div><div>Marcella<br><br>On Wednesday, February 20, 2019 at 6:16:39 AM UTC+1, M. Memol wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">I am a very recent user of cp2k and I am really sorry if my question is a naive one. I am getting familiar with calculation by cp2k. I am doing an geometry optimization run on a MOF building block. But comparing to the examples, the energy fluctuates. input and output are given below. any comment?<div>thanks in advance </div></div></blockquote></div></div></div>

<p></p>

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="eXogwZPlBQAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp2k+uns...@googlegroups.<wbr>com</a>.<br>
To post to this group, send email to <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="eXogwZPlBQAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
Visit this group at <a href="https://groups.google.com/group/cp2k" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://groups.google.com/group/cp2k';return true;" onclick="this.href='https://groups.google.com/group/cp2k';return true;">https://groups.google.com/<wbr>group/cp2k</a>.<br>
For more options, visit <a href="https://groups.google.com/d/optout" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://groups.google.com/d/optout';return true;" onclick="this.href='https://groups.google.com/d/optout';return true;">https://groups.google.com/d/<wbr>optout</a>.<br>
</blockquote></div></div>
</blockquote></div></div>