<div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>            I am running a Metadynamics calculation and one collective variable (Coordination Number b/w two atoms) is going Negative in the <b>COLAVR</b> file. I far as I know coordination number is defined as    <b>CN =</b> <b><u>1 - (r/R)**6</u>    </b>and as per this definition when I calculated the coordination number myself it is not coming out to be negative for any <br></div><div>                                                             <b>1 - (r/R)**12</b></div><div><br></div><div>time but in the <b>colvar</b> file it is showing negative value. How is it possible? <br></div><div><br></div><div>I have attached the COLVAR file and the plot of Coordination Number that I generated using above definition.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Raghav<br><b></b></div><div><b>                                                               </b><br></div></div>