<div dir="ltr">Thank you Marcella.  I'll remove TEMP_TOL and continue the NVE run.<div><br></div><div>Jerry<br><br>On Monday, September 10, 2018 at 9:00:08 AM UTC-4, Marcella Iannuzzi wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"> Dear Jerry, <div><br></div><div>your NVE system is far from being equilibrated. You have set a TEMP_TOL to 10 K, which keeps the temperature around 300 </div><div>by frequently rescaling the velocities. However, between two rescaling events, the total energy is not conserved.</div><div>Regards</div><div>Marcella</div><div>  </div><div><br>On Monday, September 10, 2018 at 12:52:42 PM UTC+2, Jerry Tanoury wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><p>Dear Forum,</p>

<p>I am running an NVT (Nose-Hoover thermostat) MD
calculation starting from a 30 ps NVE-equilibrated system.  The input file for the NVE calculation and
the corresponding .ener output (for the final 10 ps) are attached.  The NVE system appears to be
equilibrated.  However, when I use the
NVE .restart file to start my NVT calculation, I have a constant increase in the
Cons Qty (input and .ener files attached).  I am using the default Nose-Hoover thermostat and settings for v 5.1 (THERMOSTAT - Nose, REGION - global)  I’m not sure if this is a result of the thermostat type or settings, or
something else.  Any help is appreciated.</p>

<p> </p>

<p>Best regards,</p>

<p>Jerry</p></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div>