<div dir="ltr">HI all,<br>I was trying to use the collective variable ACID_HYDRONIUM_DISTANCE as my CV, but cp2k took this as an unknown subsection of COLVAR. Has anyone successfully used this CV? or this is a problem originating from my compilation, because i found that ACID_HYDRONIUM_SHELL is also not recognized by my binary. Please kindly help me out of this, i appreciate your help. I am running with cp2k-6.1. I am running on Ubuntu 14.04.4 LTS, Here is the arch file i used for compilation on:<br><br>Linux-x86-64-gfortran.popt<br><br># Tested with: GFortran 6.4, MPICH 3.2, LAPACK 3.5.0, ScaLAPACK 2.0.2<br>CC         = gcc<br>CPP        =<br>FC         = mpif90<br>LD         = mpif90<br>AR         = ar -r<br>MPI_LIBRARY_PATH   = /home/jiasen/lib<br>LIBPATH    = /home/jiasen/lib<br>FFTW_LIB   = /home/jiasen/lib/fftw-3.3.8/.libs<br>FFTW_INC   = /home/jiasen/lib/fftw-3.3.8/api<br>LIBINT_LIB = /home/jiasen/lib/libint-1.1.4/lib<br>LIBINT_INC = /home/jiasen/lib/libint-1.1.4/include<br>DFLAGS     = -D__FFTW3 -D__LIBINT -D__MPI_VERSION=1 -D__BLACS\<br>             -D__LIBINT_MAX_AM=6 -D__LIBDERIV_MAX_AM1=5 -D__MAX_CONTR=4\<br>             -D__parallel -D__SCALAPACK<br>CPPFLAGS   = <br>FCFLAGS    = $(DFLAGS) -O2 -ffast-math -ffree-form -ffree-line-length-none\<br>             -ftree-vectorize -funroll-loops\<br>             -mtune=native\<br>             -I$(FFTW_INC) -I$(LIBINT_INC) <br>LDFLAGS    = $(FCFLAGS) <br>LIBS       = $(MPI_LIBRARY_PATH)/libscalapack.so\<br>             $(LIBPATH)/liblapack.so\<br>             $(LIBPATH)/libblas.so\<br>             $(FFTW_LIB)/libfftw3.so\<br>             $(LIBINT_LIB)/libderiv.a\<br>             $(LIBINT_LIB)/libint.a\<br>             /home/jiasen/lib/libblacs-openmpi.so\<br><br><br>(MAY BE i should open another topic for the following)<br>Actually I would like to not compile cp2k-6.1 by myself were the precompiled cp2k-6.1.ssmp could work for me on a CentOS cluster. I have tried with openmpi-1.x.x and openmpi-2.x.x, but got the same problem. The problem of using the precompiled .ssmp is that it runs the job N times independently, instead of parallel. <br>the command I use is the following:<br><br>mpirun -n N .ssmp -i input -o output<br><br>if possible, please kindly guide me on how to run the precompiled excutables on my cluster.<br><br>Best Regards<br>Jiasen Guo<br><br></div>